Basic Information

Symbol
F2RL2
RNA class
mRNA
Alias
Coagulation Factor II Thrombin Receptor Like 2 PAR3 Proteinase-Activated Receptor 3 Thrombin Receptor-Like 2 PAR-3 Coagulation Factor II Receptor-Like 2 (Protease-Actovated Receptor 3) Coagulation Factor II (Thrombin) Receptor-Like 2 Coagulation Factor II Receptor-Like 2 Proteinase-Activated Receptor-3 Protease-Activated Receptor 3
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Wound age identification

MANE select

Transcript ID
NM_004101.4
Sequence length
3398.0 nt
GC content
0.4205

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-870.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -933.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 916.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((.(.....)))))).)))(((((((((.....)))..))))))(((...........((((..((((((((((((.(((....).)).)))))).(((((((((((((((...)))))))))))................((((((.(((.((....((((....)))).))))))).)))).((((((((((((.....((.......))(((((((.....))))))).((((((((((((.(((((((..((((((.((((..(((((.................(((((((...((((....))))..))))))).(((((((.(((.....((((((.(((..((((((....((((((.......(((((((......((((.(((((((....)))))))...)))).....)))))))((((.(((((..(((((.((((....((((((.((((..((((....))))..))..)).))))))((((((((.(((((((....((((..((((.....(((((((...((((...(((((..((((...))))(((...))).....(((((........))))).........(((.((.((((........)))).)).)))........))))).))))..)))))))....))))..))))(((((((....((((((.((((((..........(((....((((((((((((.........(((....)))....((((((.........(((((((((.(((....))).......)))))))))....)))))))))))))))))))))........)))))).))))))........(((((.(((((......))))))))))...(((((((..........)))))))............((((................)))).................(((((....((((........))))...)))))...((((((...(((((((....................)))))).)....))))))(((((((((.((...((((((....)))......((((...............(((((...)))))...............))))...)))....)))))))))))......)))))))(((((...)))))..))))))).))).))).)).))))))))).))))).))))..............................((.(((((((((.(((((.((........)).)))))...(((..((((((..((((..(((((...(((((.....)))))((((((((((((.(((((((.(.(((.((((((((.......)))))))).......((((((...................))))))..))).).)))))))))))))))))))...(((((.............)))))(((((((((((((.(......))).))))))).....)))).....(((((((.(((((......)))))............((((..((((((((((((....)))))))))))).....))))........))))))).)))))..))))..)).))))..))))))))).))).))..(((((((.....)).))))).)))))).)))).))..)))..)))))).(((((((..((((((((((..(((.....))).)))))))))).))))))))))))))))).............(((((((......)))))))..........(((......)))............................))))))))).))))))...)))...))))..)))))))))))).....((((......)))).....))))))))))))))))......((((((((.(((((((((((.((((...((((((((((((((((((..((((.(((((....................(((((...)))))............((((((((((.(((............))))))))))))).(((.....)))(((((.(((..((((..((((.((............)).))))..))))..))).......................................(((((((((..(((((...(.(((((..(((.....)))))))).)...)))))..)))).))))).((((((((......))))).....))).)))))((((((...((...(((((.((((..((((....(((.(((.((((....((.((((((............((((((.(.(((..((((.....))))))).).))))))..((((((((....(((((...(((......))).....................(((((((........)))))))((((((((((((..((((((((((.((((((((..(((((((.((.(((.........)))...))))))))).....(((((....(((((......))))).((((..(((((..........(((((((.......(((((...)))))..((((..(((((...)))))..))))(((((((....(((.((((.........(((((((((...((((..((((.(((.((((.......((((((....(((........)))...))))))....)))).))))))).))))..)))))))))(((((...(((......).))....)))))....))))...))).....))))))).(((((.((((..........)))).))))))))))))...........)))))..))))....)))))...(((((...........((((((......((..(((((....)))))..))......))))))..)))))........))))))))((((((..((((((...........((((.(((((((...)))))))...)))).............))))))...))))))))))))))))...((((....((((((..(((...(((((....)))))))))))))).....)))).........)))))))).))))..)))))...))))))))......)))))).))......((......)).))))))))))..)))).)))).)).)))..))...)))))).........))))).)))))))))...)).))))))))))).))))..)))))))))))...))).))))).)))))).))))...........))).................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{{(({,..|}})}....(((({,{(((((((((.....)))},})))}}{{,...,,,,....((((..(((((({(((((.(((....).)).)))))}.{((((((((((((((...))))))))))).,...||,....((((,.{{{{{,((.({,.(((((.((...(((((,(((...(((((((.,..((((((((..,{{,,,{({{(,,,{{{{,.,,,.||||||||{(((,,(((((({........{((((...))))}.((((.....}}}}.....,,{,(((((((...((((....))))..))))))},|{,{{{,((((.,,.}|||{||,,|||||||},||...,,{{{,,,,{{,.((((((({..,..{(({.(((((((....)))))))...}}}}..,.}))))))).,|,,,,{||..,..{{{.....,},,(((((.(((({{((,,...{||||{.{|{{,,.|||(({{((({..,,||||({{,.{(((((..((((..,..(((((((...((((...(((((.,{(({...,,},(({...})),,,,{({(((........}}}|}|,....,,|{{{.,{,{({{........)))),)),))).,,,...,))))).))))..))))))).,..))))..))))))}},......((((((.((((((..,.......(((....(((((((((((((........{{,....|||....|,||{,.....,,..(((((((((.(((....))}.......)))))))))....)))))))))))))))))))))........)))))).))))))........((({{{(((((......))))))))))...(((((((..........))))))).........,|.(((,......,,,.......,,,,.................(((((....((((........))))...))))}...,,,,,,.,{{,,,|||},..,...,,))})}}}...)))),)}.}}}}))))))||,{{||||},||{{((.(((....)))..}}},||||,,,,}},...{{{{{(,,,...}))))).........})}})})..)}}}))),,},.}),},))))}.....{((((((({{({{...,}}}}...,,,.{{..,,.))((((((((.((....))))))))))......(((((..{{((((...{{{,......,{{.,{{{.,.(((((.{{........}}.)))))...)))).,.}))))).))))).)))))))|,{(({{,,.|}})}||||,,|{{|||.|.{(((({(.,,{.((((((((.......))))))))......}}}}}||,,{{{{.{{{{{{..{{{{|,||....)),.)}))),))))))))))))}||,..{||||,............}}}}}(((((((((((((.(......))).))))))).....}))}....))))))))......{(((((((((..{........)..)))))))))|(((((((....))))))),))))))).))),)))))...)).))))),)})),})))}}}})...,}},}}}}|||,,,,,,,,||(((((((({{,....|.(((((.{({..(((....)))..))}.)))))}.(((((((..((((((((((..(((.....))).)))))))))).})))))).((({....{....,....}}}}(((((((......)))))))......,,{{((({,,{{,.||{{{{{,..((((.{{{{{{{{{....{{||||{||||..,|.{,,,,,}|.|,..,|,.,,,,.............{(((......)))}...|,|}||||||||||||........(((((((({(((((((((,({((....}|||,||{,,,,,{{{{,....,,..({{{{.,,.................(((((,,,|}}}),,,..,......((((((((((.(((............))))))))))))).{{{.....}))|{,,,.(({..((((..((((,((.,,....,}...}}.))))..))))..}}}...................................})}}|||||||||}}(((((...{.(((((..({{.....,),))))).}...)))))..,,,,.,||||{((((.....}).)))))))....}))),,,)))}|||||}},,|||.,,||,.,{||..,,,|,,,,||,.,,({(((,....((.((((((............((((((.{.(((..((((.....))))))).).))))))..((((((((....(((((...,{{......}}}.....................(((((((........)))))))((((((((((((..((((((((((.((((((((..((((((({((.,,,.,.......}))...))))))))).......((((.((,.((((((.,...(((((..,(((.{{({..,.....((((,,{,,{{{{,.((,{{,|||||||..((((..(((((...)))))..)))}{,|||.,,,........{{{,{......,|,,,,..,|||||.....,,|||||.{((({.{((({(.....}}}}}}.}}}},...,.....)))))},.,,.{((((.((((.((((((.((((({,.........,}}}}}}...((((,..{(((((..((.((((....))))..))..))))))))))..{((((({,........,{{{{{..,{,..,,.....,..)))}}}))}}},...}},},,))})))))))))))).)))))))}},,},},||....)})),)}}..))))).....,.))))))..)))))).......)))))))){(((((..((((((...........((((.(((((((...}))))))...)))).............))))))...))))))))))))))))...((((....((((((..(((...(((({....}))))))))))))).....)))).........)))))))).))))..)))))...))))))))......)))))).))....}})))...,,)},),))))))))}..,,)}))))}))))),..))}.}))))))}........)))))})))),,,}|...,,.,},}}||||||,|}}},.|||||,,,})))),})).)))))})))))).))))..........,)))))...............................

Transcripts

ID Sequence Length GC content
CUUUCCCUGCGGAGGACCAGGGCAAGUUUCCUGCCUGCACGGCACAGGA… 3268 nt 0.4195
CUUUCCCUGCGGAGGACCAGGGCAAGUUUCCUGCCUGCACGGCACAGGA… 3398 nt 0.4205
Summary

This gene encodes a member of the protease-activated receptor (PAR) family which is a subfamily of the seven transmembrane G protein-coupled cell surface receptor family. The encoded protein acts as a cofactor in the thrombin-mediated cleavage and activation of the protease-activated receptor family member PAR4. The encoded protein plays an essential role in hemostasis and thrombosis. Alternate splicing results in multiple transcript variants that encode different isoforms. [provided by RefSeq, Feb 2012]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the F2RL2 as a shared upregulated differentially expressed gene between HCM-affected animals and pediatric/adult human hypertrophic cardiomyopathy [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4]. In a separate study using a rat model of mild traumatic brain injury, the F2RL2 exhibited decreased expression in the first hour post-trauma, with a gradual increase thereafter, indicating a time-dependent response to brain injury [Colak et al. DOI:10.1016/j.injury.2012.01.021].