Basic Information

Symbol
F3
RNA class
mRNA
Alias
Coagulation Factor III, Tissue Factor TF Tissue Factor CD142 Coagulation Factor III (Thromboplastin, Tissue Factor) Coagulation Factor III Thromboplastin CD142 Antigen TFA
Location (GRCh38)
1:94529173-94541851
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001993.5
Sequence length
2298.0 nt
GC content
0.4282

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-643.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -687.48 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 584.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001178096.2 NCBI
AAGACUGCGAGCUCCCCGCACCCCCUCGCACUCCCUCUGGCCGGCCCAG… 2138 nt 0.4275
NM_001993.5 NCBI
AAGACUGCGAGCUCCCCGCACCCCCUCGCACUCCCUCUGGCCGGCCCAG… 2298 nt 0.4282
Summary

This gene encodes coagulation factor III which is a cell surface glycoprotein. This factor enables cells to initiate the blood coagulation cascades, and it functions as the high-affinity receptor for the coagulation factor VII. The resulting complex provides a catalytic event that is responsible for initiation of the coagulation protease cascades by specific limited proteolysis. Unlike the other cofactors of these protease cascades, which circulate as nonfunctional precursors, this factor is a potent initiator that is fully functional when expressed on cell surfaces, for example, on monocytes. There are 3 distinct domains of this factor: extracellular, transmembrane, and cytoplasmic. Platelets and monocytes have been shown to express this coagulation factor under procoagulatory and proinflammatory stimuli, and a major role in HIV-associated coagulopathy has been described. Platelet-dependent monocyte expression of coagulation factor III has been described to be associated with Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) severity and mortality. This protein is the only one in the coagulation pathway for which a congenital deficiency has not been described. Alternate splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Aug 2020]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that overfeeding induced differential expression of 45 genes in abdominal subcutaneous adipose tissue, with six genes showing a significant interaction between adiposity status and treatment [Shea et al. DOI:10.3945/ajcn.2008.25970].