Basic Information

Symbol
F5
RNA class
mRNA
Alias
Coagulation Factor V Coagulation Factor V (Proaccelerin, Labile Factor) Activated Protein C Cofactor Coagulation Factor V Jinjiang A2 Domain Proaccelerin, Labile Factor Factor V Leiden RPRGL1 THPH2 PCCF FVL
Location (GRCh38)
1:169511951-169586588
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000130.5
Sequence length
9132.0 nt
GC content
0.4312

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2399.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2575.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2364.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000130.5 NCBI
AUUGCAGCUGGGACAGCCCGGAGUGUGGUUAGCAGCUCGGCAAGCGCUG… 9132 nt 0.4312
Summary

This gene encodes an essential cofactor of the blood coagulation cascade. This factor circulates in plasma, and is converted to the active form by the release of the activation peptide by thrombin during coagulation. This generates a heavy chain and a light chain which are held together by calcium ions. The activated protein is a cofactor that participates with activated coagulation factor X to activate prothrombin to thrombin. Defects in this gene result in either an autosomal recessive hemorrhagic diathesis or an autosomal dominant form of thrombophilia, which is known as activated protein C resistance. [provided by RefSeq, Oct 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.