Basic Information

Symbol
F7
RNA class
mRNA
Alias
Coagulation Factor VII Eptacog Alfa Coagulation Factor VII (Serum Prothrombin Conversion Accelerator) FVII Coagulation Protein Proconvertin EC 3.4.21.21 SPCA Serum Prothrombin Conversion Accelerator Factor VII EC 3.4.21
Location (GRCh38)
13:113105762-113120685
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_019616.4
Sequence length
3063.0 nt
GC content
0.5720

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1150.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1205.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 859.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000131.4 NCBI
GUCAGUCCCAUGGGGAAUGUCAACAGGCAGGGGCAGCACUGCAGAGAUU… 3144 nt 0.5709
NM_001267554.2 NCBI
AGUCCCAUGGGGAAUGUCAACAGGCAGGGGCAGCACUGCAGAGAUUUCA… 2877 nt 0.5669
NM_019616.4 NCBI
AGUCCCAUGGGGAAUGUCAACAGGCAGGGGCAGCACUGCAGAGAUUUCA… 3063 nt 0.5720
Summary

This gene encodes coagulation factor VII which is a vitamin K-dependent factor essential for hemostasis. This factor circulates in the blood in a zymogen form, and is converted to an active form by either factor IXa, factor Xa, factor XIIa, or thrombin by minor proteolysis. Upon activation of the factor VII, a heavy chain containing a catalytic domain and a light chain containing 2 EGF-like domains are generated, and two chains are held together by a disulfide bond. In the presence of factor III and calcium ions, the activated factor then further activates the coagulation cascade by converting factor IX to factor IXa and/or factor X to factor Xa. Defects in this gene can cause coagulopathy. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms that may undergo similar proteolytic processing to generate mature polypeptides. [provided by RefSeq, Aug 2015]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.