Basic Information

Symbol
FADS2
RNA class
mRNA
Alias
Fatty Acid Desaturase 2 D6D SLL0262 FADSD6 TU13 DES6 Acyl-CoA 6-Desaturase Delta-6-Desaturase LLCDL2 Linoleoyl-CoA Desaturase (Delta-6-Desaturase)-Like 2 Delta(6) Fatty Acid Desaturase Delta-6 Fatty Acid Desaturase Delta(6) Desaturase Delta-6 Desaturase EC 1.14.19.3 EC 1.14.19
Location (GRCh38)
11:61792980-61867354
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004265.4
Sequence length
3091.0 nt
GC content
0.5898

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1303.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1351.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 663.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001281501.1 NCBI
AUCCUUGCUCUCCUCCCUCCUAGCCUACCCAGCUCGGGGUUCUGUCCCC… 3025 nt 0.5838
NM_001281502.1 NCBI
GACACCCAAUCACCGGGCAACAGGUAUGAUCAGGCGCCUCCGGGCUUUC… 3094 nt 0.5873
NM_004265.4 NCBI
UGCACACACCGGCUGGGAGGCAGCCGUCUGUGCAGCGAGCAGCCGGCGC… 3091 nt 0.5898
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the fatty acid desaturase (FADS) gene family. Desaturase enzymes regulate unsaturation of fatty acids through the introduction of double bonds between defined carbons of the fatty acyl chain. FADS family members are considered fusion products composed of an N-terminal cytochrome b5-like domain and a C-terminal multiple membrane-spanning desaturase portion, both of which are characterized by conserved histidine motifs. This gene is clustered with family members at 11q12-q13.1; this cluster is thought to have arisen evolutionarily from gene duplication based on its similar exon/intron organization. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2013]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the FADS2 exhibited transient "spikes" in expression, most notably in the polyA+ fraction of RNA from white blood cell fractions, indicating a transient response associated with spaceflight [Schmidt et al. DOI:10.1159/000506769]. Another human study found that the FADS2 gene was up-regulated in abdominal subcutaneous adipose tissue in response to a 7-day overfeeding intervention [Shea et al. DOI:10.3945/ajcn.2008.25970].