Basic Information

Symbol
FAM107A
RNA class
mRNA
Alias
Family With Sequence Similarity 107 Member A DRR1 TU3A Down-Regulated In Renal Cell Carcinoma 1 Actin-Associated Protein FAM107A Family With Sequence Similarity 107, Member A Down-Regulated In Renal Cell Carcinoma Protein FAM107A Protein TU3A
Location (GRCh38)
3:58564117-58627651
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001076778.3
Sequence length
2994.0 nt
GC content
0.5307

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1055.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1112.37 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 580.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001076778.3 NCBI
CUUGCUAGUCUGGGACUUCCCGGUGGAGUGAGGAACCCAGCAACACGCU… 2994 nt 0.5307
NM_001282713.2 NCBI
GCUUCGGCUCCGGACUACGCUCCUGCUGUGCGCUCGCGGGGCCAGCAGU… 3068 nt 0.5404
NM_001282714.2 NCBI
AGUUGAAUGAAGGAGUCUGCUCUCAGAGUAUCUGCUGUGGGAGAGCCCC… 3615 nt 0.5466
NM_007177.4 NCBI
CUUGCUAGUCUGGGACUUCCCGGUGGAGUGAGGAACCCAGCAACACGCU… 3092 nt 0.5268
Summary

Predicted to enable actin binding activity. Involved in several processes, including negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; negative regulation of focal adhesion assembly; and regulation of cytoskeleton organization. Located in several cellular components, including focal adhesion; ruffle membrane; and stress fiber. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rhesus macaques demonstrated that whole-thorax irradiation induced significant transcriptomic dysregulation in lung tissue, where the FAM107A was identified as one of the top downregulated transcripts among common differentially expressed genes in irradiated animals compared to sham controls [Priyanka Thakur et al. DOI:10.1016/j.ijrobp.2021.03.058].