Basic Information

Symbol
FAM114A2
RNA class
mRNA
Alias
Family With Sequence Similarity 114 Member A2 133K02 C5orf3 Protein FAM114A2 Family With Sequence Similarity 114, Member A2 Testis Tissue Sperm-Binding Protein Li 81P Chromosome 5 Open Reading Frame 3
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_018691.4
Sequence length
4414.0 nt
GC content
0.3763

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1135.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1221.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1335.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((.....((((((((((((.(((.(....).))).))))).....))))))))))))....((((((........))))))((((..(((.(((((......)))))...(((((......)))))..((((((.(((((((..((..((((.(((((((((....(((.....)))..((.((........))))((..(((((....)))))..))(((((((....(((((((((((((((((((.((((..(((((((((......(((.......)))...((((.((((((.......)))))))))))))))))))((((..((((((((.((((((..((((((((((...)))))...(((((((((((((((.(((((.((..............((((((..((((((((.(((....))).))..))))))..)))))).......((((((.(((((....((....((((((((.........((((((...)))))).........))))))))..))))))).)))))).....(((((........))))).......)).)))))))))))))...((((((((.........))))))))(((.(((((...(((((((((((.(((....))))).)))))))......))....))))))))........)))))))..)))))..)))))).........((((((((((....)))))..))))).....................)))))))).))))....))))))))))))....)))).((((((...))))))...((((((....))))))........((((((((((((((((((((((((......)).)))))))(((.((((((........))))))...))).........((((((((.......((((......))))......))))))))...)))))..)))))))))).............(((((......)))))(((.(((((((.......)).))))).)))..((((..........)))).....))))..)))..))))))).........))))))).....((((((((((((((((.(((((((((((((((((...(((.((((...((((.((((((((((((.....((((((((((...((..(((.((((((.(((..(((((((((.....((((((...(((......).))...)))))).....)))))...))))..)))..))))))..(((((((((((((((((((..((((.(((((((.(.........).)))))))...))))...)))))))..(((((((.((((........))))((((......))))....((((((((((((((((...((((((........(((((((......))))))).((((((((((..(((((.(((((.(......(((((.....(((((.((((...))))...)))))......)))))....)))))).))))).......(..(((....)))..).((((((....))))))..))))))...))))..(((((..(((((......))))))))))....))))))(((((((...((((((...(((((.....)))))((((((((.((((((..(((....((((((((((((((((((..(((((((.(((((..(((((.((((((((.(((.((((((.(((.....((((((....))))))))).)))))))))..)).))))...))..))))).....(((......)))))))).))))))).))))))......)))))))))))).....((((((((.(..((((............))))..)))))))))((((((((....((((((....))))))..........(((((....)))))))))))))((((((((((((.((((.((((((.......(((.....)))........)))))).))))..)))))..))))))).....((((((((((.......)))))))).)).......(((((.....)))))(((((((.............)))))))....((((.....(((.(((((((((..........((.(((..(((((((((((((((.((((....(((((.(((((((..........(((.((((((.......))))))..)))..........((((((........))))))...))))))).)))))((((........))))(.((((((((((....)))))))))).)...(((..(((((.((((((((((((......((((.(((((((...((((((((((((((.....)))))))..(((((.........(((.((.(((((((.......(((((((((.((((((...)))))).))).))))))..))))).)).)).))).........))))).)))))))..)))))))))))..))))))...)))))).......(((.((((((.......((((((((..(((((((((((......)))))...))))))...)))))..))).......)))))).)))..)))))..))).....((((((((.....(((......))))))))))).......)))).)))))))((((((((((...........................(((((((((((((((((.(((.....)))(((((....)))))........((((........)))).......................((........)).))))))).))))))))))((((.(((....)))...))))....)))))).))))))))))))..))).)).............(((((.((......)).))))).....)))))).))).)))))))....(((((((.......)).))))).(((((((((........))))))))).......))))))))).)))))))).(((((((....))))))).......(((((.((....))))))).((((..((((((((((((((.((((((((((...((((.(......).)))).......))))).)))))))))))).)))))))))))(((((.(((((((((.(((....))).)))..))))))..)))))............(((((.(((.....))).)))))(((((....)))))(((((.........((((((((((((.................(((((.((((((((..(((........)))))))))..)).)))))....((((.......))))........)))))))))))).......)))))...)))))).....)))))))...))))))).)))))))))..(.(((((((((((((..(((........(((((((....)).)))))..........((((((((...((((((((.....((.(((((((((((..................((((((.....)))))).......(((((((....)))))))..))))))))))).))...))))))))...)))))))))))))))))))))))).))))))))...(((((....(((.......)))....))))).))))).......))))))).((((..(((((.........)))))..))))........((((((...((.((((((((.........)))))))).))...)))))).))).))))))))))))....)))).)))))))).))))....)))).......((((.(..((((((..(((......)))..))))))..)))))((((((....))))))..(((((.(((((............))))).)))))...))).)))))))......)))))))))).))))))))))))))))....)).))))..))..)))))))..((((((((((((.((((.(((......(((.((((((((((((((((((((....((((((.((((..(((((...((((...))))(((.(((.........))).))).)))))....)))).))))))....))))(((((((((((.....((((((....)))))).....)))))))))))....))))).)))).))))))).)))((((.....)))).....)))..))))..)))))).))))))((((((..((((((((.((((...))))))))))))....))))))...........)))))))))..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((.(({,{(((((((({(({((({.{{{,|{|}||||||||||.{{{{{{{{{{{,,..{{{{{{{{......,,||||||{||||..{|..,|||,,|||.|((||...(((((......)))))..,||||..|||.}}},.....,{((.(((....)))},.(((.....))).,{({{{,...,,{,|{|{{,,{((((({{{.||||,....,,,..........}}}}}}}}....,||||||{|,..{|||||{((,.....(((.......)))...{{{{.((((((.......)))))))))))))))}|||{{{|..|||},.,))),,))))))),,))))))),))}))).}}}}.||,|..||.,||||||,}|||,||.....{{{{||((((((,.|||||||.||((|||||||{|{..,,))}}}}),,,,,......,((((((.{((((....((....((((((((....{,...((((((...)))))).....},,.))))))))..)}))))}.)))))}..,..((((({{{.,{{{|||||....{,((({(({({{{(((((,,{,((((((((.........))))))))(((.(((((...(((((((((((.(((....))})),,))))))......))....))))))))..|||,,||{{,...(((((((,,,{{{{,..{{((((.{(((((((((....)))))..))))|................{(({,,.,))}...))))))..,...))))...)))))))...{(((((,,.,|||}|{.,((((((....))))))........(((((((((((((((({{((((((......))}}}}}}},(((.((((((........))))))...))).........{(((((((..,....{(({....,,))}}......))))))},..,)))))..)))))))))),(((({{{..{..,((((...,{{||||}{{{.{{{{{{{{.......))))))).}}).,||||,......,,,}))),,...{||,|||||.,,,}))))})),.{{{{{,.||{{,,.,,{{({{,({((,,,,,{.(({(((({{((,,{{{,.{{(((,,{{{,.......{((,.,,{{((,,..{{,{((.{{{|}|..{{|||{|||{{{|||{{|||||.{{|||||,,,,{{,...,}}},,.,,,,,{||{||,}{|||}||},,}))||...(((((.(((((...{..((((.(((((...((((((((...(.((((({....)))))).}))))))))...))).)).))))..}.,.))))).)))))........,)))||||,...|||..||||,{||}}||||,,..,,,,,,..,||,|||..}}}}},(((((((......))))))).,,}}}}||||,},||||.,||||}}}}}}.}|||||}}.{{(((((.{{({.,{||,,{{{,||||{{,{,,||,||,.{{|||,,|{|||||{(({.{{({{{(({{{{{{,.,{{((,.(({{{{.||||{,.,.|||{{...|{(,,((({{{(({,.{,,....,..||||||{{{{{{|.{{,...}}.||||||||,((((....(((((((,{(({,.((((,((((((((.((...{((((({,((((((,{((((({(((.....}}}||,....,},|,,{({({({.({.((((({.((,,(((((.{(((....{{{.{{||||{{{..,|||}}.}})),}}}....)))),))))),}}.},..}))).)}}))}|(((((((((((((((,{,{{({{.....,|}}},.((((((((,(,.((((.,,......,,.)))),.})))))))){(((((((....((((((....))))))..........{((((....))))})))))))|((((((((((((.((((.((((((...{{,.(((.....)))..}}....)))))).))))..)))))..))))))),....,,((((((((.......)))))))).||{{{{{{{,,,.{{{{|{|||||{.(((((((((((((((...{((((....,,((({{((((((((((...(((.....((((((...,.........)))))).....)))..)))))))))))..}}},...,,,...,||}((((((.......)))))).,))),,..))))}.((((((........))))))...,.)))))))))))))))......|||||||.((((((((({....}))))))))).}.,,.{{{,{,.,,.,}}})}||||.....,||..,{{{||}|||(((...)))..}})}}}))),)),}),,,.,))))))})))))))))))))))}((({(,,,....(((((((((.{(((((...)))))}.))).))))))..))))).,))))))))))}.}})))))))))))))).)})),,}))))).))))))}...})))........{{{{.......}}}}..}}}||.,,,,{{|(({{{{(((((......)))))...)))))},...,,})}}))}}}},},||||||,,..,}}))),..,))}}}}},,,..,}}},.))))}}.}}})},})),},}})))),},))))}.,)))),,,}}))))),,)}}},..,,,...,},..}}}|.....,(({{{{{{(({{{{|||.|{{.....}}}{((((...,|}}}}..,.,|..{{{(..,,,...}}}}....,,{{{{{{{{{{{{,,.,.,(,,,{{,,.||{|}}}},},||||||||,|,{..}}}))).}},.,,,,,),,.{|{||||,||||||}|}}..{((((..(((((,(....{((((((.((((((((((.{{{.{{{.({{,......,)},....,},.,...(((((((.......)).))))}.|||.|||,,}},.))))))))))..)))))))....}))))}.))))}....(((((((....)))))))..||,|.{(({|.{|,...))))})),}||||.((((((((((((((.((((((((((...((((.{......}.)))).......)))))))}))))))))))}}}))))).}}.(((((.(((((((((.(({....,)).)))..))))))..)))))....,,,.,,,,{(,,{,,,,..,..}))})))}}|{{{{,,,.}|||{(((((((({........,((((((((....})))))))))))).))))}|{,|||||}.|||,}}}}..})))...{{{((((((((((.....{((((({................(((((((..((.{{...,{{{,,,,,,,({{{,.(,{......})}....}))).)...))),((,..(((((((((((((,.(((........(((((((....)).)))))..........((((((((...((((((((.....((.(((((((((({.................,((((((.....)))))).,,,...(((((((....)))))))..))))))))))).))...))))))))...))))))))))))))))))))))))}))|(((((..((((({..,((((.,,....)).}))))))),..})..))))},..((((((((({((((((((...(((({{{{{(,(,{.,,.,,.....((((((...((.((((((((.........)))))))).))...))))))...}))))))),.,,)))))....})))),,)))),))))))))).}).))..)))))))))))})}..))))))))))))),,,|||||..,,)))}}||,,...,}}}},,..{((((.(((((............))))).))))).,,}}}.,,))})),,...,))))))))}}.})))))))))))))))}}.{{{{{.||{.|.{(((((,{.{{(((((({,,,,{{{{{{.....,.})))})))).)))....}}.}.}))))),.})).})))).,||,||||,.,}|||,...))))}}}.)))..))}}.}}...,}}})))},),))))))))),((.(((((((.,.({{((..,.,.,,,...,,,,}},))))),)}}})}),))(((((,,{(((..{{{{,,,,...)))).}}}})))))....{(((,((({(......)))}),)))),.|||,(((((((..(((((((,{((({...})))))))))))....))))))}........((({...))))..))),.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGUAGGAACGCCGAGUCGGCUGCCGUGGCUGUGCUGAGGGUGGCGGCCG… 4461 nt 0.3779
AGUAGGAACGCCGAGUCGGCUGCCGUGGCUGUGCUGAGGGUGGCGGCCG… 4978 nt 0.3949
AGUAGGAACGCCGAGUCGGCUGCCGUGGCUGUGCUGAGGGUGGCGGCCG… 4204 nt 0.3708
AGUAGGAACGCCGAGUCGGCUGCCGUGGCUGUGCUGAGGGUGGCGGCCG… 4414 nt 0.3763
Summary

Predicted to enable purine nucleotide binding activity. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.