Basic Information

Symbol
FAM13A
RNA class
mRNA
Alias
Family With Sequence Similarity 13 Member A KIAA0914 ARHGAP48 FAM13A1 Family With Sequence Similarity 13, Member A1 Protein FAM13A Family With Sequence Similarity 13, Member A FAM13A1_v2 Protein
Location (GRCh38)
4:88725955-89111398
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014883.4
Sequence length
5866.0 nt
GC content
0.4454

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1717.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1825.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1856.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001015045.3 NCBI
GUAAAUGUAGAGAAGCAGCCGAUAAAAUAGCAUUGCCUGAAGAAGUUUG… 4895 nt 0.4454
NM_001265578.2 NCBI
GUAAAUGUAGAGAAGCAGCCGAUAAAAUAGCAUUGCCUGAAGAAGUUUG… 4853 nt 0.4457
NM_001265579.2 NCBI
GUAAAUGUAGAGAAGCAGCCGAUAAAAUAGCAUUGCCUGAAGAAGUUUG… 4811 nt 0.4438
NM_001265580.2 NCBI
GUAAAUGUAGAGAAGCAGCCGAUAAAAUAGCAUUGCCUGAAGAAGUUUG… 4811 nt 0.4450
NM_014883.4 NCBI
AACUCCAGGCAGUCCUUCCAGCCAUGUGGGUUCAGCGGAAAGAGAAGCA… 5866 nt 0.4454
Summary

Predicted to enable GTPase activator activity. Predicted to be involved in regulation of small GTPase mediated signal transduction. Predicted to be located in cytosol. Implicated in chronic obstructive pulmonary disease. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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