Basic Information

Symbol
FAM171B
RNA class
mRNA
Alias
Family With Sequence Similarity 171 Member B KIAA1946 Protein FAM171B FLJ34104 Family With Sequence Similarity 171, Member B
Location (GRCh38)
2:186694019-186765959
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_177454.4
Sequence length
5731.0 nt
GC content
0.3778

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1421.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1541.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1143.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_177454.4 NCBI
GCAGAUUGCGCGAGGGGGAGCGAGCGAGCGGGCGCUGCCAGGAGCCCGC… 5731 nt 0.3778
Summary

Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in synapse. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the FAM171B was downregulated (0.549-fold reduction) in lung tissue following hypothermia-induced death, identifying it as a candidate forensic biomarker for this condition [Takamiya et al. DOI:10.1016/J.Legalmed.2020.101789].