Basic Information

Symbol
FAM83D
RNA class
mRNA
Alias
Family With Sequence Similarity 83 Member D DJ616B8.3 C20orf129 CHICA Spindle Protein CHICA Protein FAM83D Family With Sequence Similarity 83, Member D Chromosome 20 Open Reading Frame 129
Location (GRCh38)
20:38926312-38953106
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification Individual identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_030919.3
Sequence length
2370.0 nt
GC content
0.5076

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-794.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -840.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 527.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

Enables kinesin binding activity; microtubule binding activity; and protein kinase binding activity. Involved in several processes, including positive regulation of cell cycle G1/S phase transition; protein localization to mitotic spindle; and regulation of intracellular signal transduction. Located in cytosol; intercellular bridge; and mitotic spindle pole. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the FAM83D is a vaginal secretion-specific mRNA marker used for body fluid identification and individualization, with its associated cSNPs (rs77993973, rs3752293) enabling donor assignment [Liu et al. DOI:10.1007/s00414-025-03434-0]. A review of forensic transcriptomics further catalogued the FAM83D as a validated mRNA marker for vaginal secretion identification [Lei et al. DOI:10.1093/gpbjnl/qzag007].