Basic Information

Symbol
FARSB
RNA class
mRNA
Alias
Phenylalanyl-TRNA Synthetase Subunit Beta FRSB FARSLB PheHB Phenylalanyl-TRNA Synthetase-Like, Beta Subunit Phenylalanine TRNA Ligase 1, Beta, Cytoplasmic Phenylalanyl-TRNA Synthetase Beta Subunit Phenylalanine--TRNA Ligase Beta Subunit EC 6.1.1.20 PheRS Phenylalanine-TRNA Synthetase-Like, Beta Subunit Phenylalanyl-TRNA Synthetase Beta Chain Phenylalanine-TRNA Ligase Beta Chain EC 6.1.1 HSPC173 NEDBLLA RILDBC1 RILDBC RJBS
Location (GRCh38)
2:222566899-222656313
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005687.5
Sequence length
6761.0 nt
GC content
0.3999

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2007.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2137.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1873.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005687.5 NCBI
GCAGUGAGUUCGACACACCAUGCCGACUGUCAGCGUGAAGCGUGAUCUG… 6761 nt 0.3999
Summary

This gene encodes a highly conserved enzyme that belongs to the aminoacyl-tRNA synthetase class IIc subfamily. This enzyme comprises the regulatory beta subunits that form a tetramer with two catalytic alpha subunits. In the presence of ATP, this tetramer is responsible for attaching L-phenylalanine to the terminal adenosine of the appropriate tRNA. A pseudogene located on chromosome 10 has been identified. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2015]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.