Basic Information

Symbol
Fat3
RNA class
mRNA
Alias
FAT Atypical Cadherin 3 CDHF15 KIAA1989 CDHR10 Cadherin-Related Family Member 10 FAT Tumor Suppressor Homolog 3 Cadherin Family Member 15 Protocadherin Fat 3 HFat3 FAT Tumor Suppressor Homolog 3 (Drosophila)
Location (GRCh38)
11:92224818-92896473
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001367949.2
Sequence length
19504.0 nt
GC content
0.4549

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-6044.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001008781.3 NCBI
AGUAGCGGCGGCGGCUGCAGCUCGGAGCAGACAGGAGAGCCGGCGCUCC… 19408 nt 0.4550
NM_001367949.2 NCBI
AGUAGCGGCGGCGGCUGCAGCUCGGAGCAGACAGGAGAGCCGGCGCUCC… 19504 nt 0.4549
Summary

Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cell-cell adhesion. Predicted to act upstream of or within generation of neurons; negative regulation of dendrite development; and retina layer formation. Predicted to be located in dendrite and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

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