Basic Information

Symbol
AK4
RNA class
mRNA
Alias
Adenylate Kinase 4 AK3L1 AK3 Adenylate Kinase 4, Mitochondrial Adenylate Kinase 3-Like 1 GTP:AMP Phosphotransferase AK4, Mitochondrial Adenylate Kinase Isoenzyme 4, Mitochondrial Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Nucleoside-Triphosphate-Adenylate Kinase Mitochondrial Adenylate Kinase-3 GTP:AMP Phosphotransferase AK4 ATP-AMP Transphosphorylase Adenylate Kinase 3-Like Adenylate Kinase 3 EC 2.7.4.4 EC 2.7.4.6 EC 2.7.4.3 EC 2.7.4 AK3L2 AK 4
Location (GRCh38)
1:65146902-65232145
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_013410.4
Sequence length
6845.0 nt
GC content
0.4172

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1935.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2072.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1746.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001005353.3 NCBI
GCAGACCACACGUUGCCCACGUGCGAGGACCGGGCAGGGGCUCAGCCCC… 6975 nt 0.4241
NM_001330616.2 NCBI
AGUCGGGCGGGGCCGCGCGCCGGGGAACCUGUGGCGCCGGGGGGCUCGC… 6642 nt 0.4106
NM_013410.4 NCBI
AGUCCGCCUGCUACUCGGUCCCGGCGCUGGGCUGAGGGGAGGGGUUGUC… 6845 nt 0.4172
NM_203464.3 NCBI
CGUAAGGCGCGAGUCCCGCGCGGCCGGCCGGGGCUCCGCGACUGGGCGG… 6884 nt 0.4210
Summary

This gene encodes a member of the adenylate kinase family of enzymes. The encoded protein is localized to the mitochondrial matrix. Adenylate kinases regulate the adenine and guanine nucleotide compositions within a cell by catalyzing the reversible transfer of phosphate group among these nucleotides. Five isozymes of adenylate kinase have been identified in vertebrates. Expression of these isozymes is tissue-specific and developmentally regulated. A pseudogene for this gene has been located on chromosome 17. Three transcript variants encoding the same protein have been identified for this gene. Sequence alignment suggests that the gene defined by NM_013410, NM_203464, and NM_001005353 is located on chromosome 1. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that in vivo exposure of liver cells to α-particles or γ-rays via boron neutron capture induced significant transcriptional changes, with the AK4 gene being commonly down-regulated by less than half in all irradiated groups compared to non-irradiated controls [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].