Basic Information

Symbol
FBXL4
RNA class
mRNA
Alias
F-Box And Leucine Rich Repeat Protein 4 FBL4 FBL5 F-Box/LRR-Repeat Protein 4 F-Box And Leucine-Rich Repeat Protein 4 F-Box Protein FBL4/FBL5 MTDPS13
Location (GRCh38)
6:98868535-98948006
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001278716.2
Sequence length
8058.0 nt
GC content
0.3661

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2096.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2262.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2358.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001278716.2 NCBI
CCUUCCGGGUCGCGCUAGGCCGGGCUUGCGGCGGUUGUGCCGCAUCUAG… 8058 nt 0.3661
NM_012160.5 NCBI
CCUUCCGGGUCGCGCUAGGCCGGGCUUGCGGCGGUUGUGCCGCAUCUAG… 7940 nt 0.3650
Summary

This gene encodes a member of the F-box protein family, which are characterized by an approximately 40 amino acid motif, the F-box. F-box proteins constitute one subunit of modular E3 ubiquitin ligase complexes, called SCF complexes, which function in phosphorylation-dependent ubiquitination. The F-box domain mediates protein-protein interactions and binds directly to S-phase kinase-associated protein 1. In addition to an F-box domain, the encoded protein contains at least 9 tandem leucine-rich repeats. The ubiquitin ligase complex containing the encoded protein may function in cell-cycle control by regulating levels of lysine-specific demethylase 4A. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013]

Forensic Context

A study in humans characterized the platelet transcriptome in acute myocardial infarction patients and identified the FBXL4 as having suggestively higher expression in platelets from ST-segment elevation MI (STEMI) patients compared to non-STEMI patients [Eicher et al. DOI:10.3109/09537104.2015.1083543].