Basic Information

Symbol
FBXO10
RNA class
mRNA
Alias
F-Box Protein 10 FBX10 F-Box Only Protein 10 PRMT11 F-Box Protein Fbx10
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Postmortem interval inference

MANE select

Transcript ID
NM_012166.3
Sequence length
4702.0 nt
GC content
0.5627

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1856.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1934.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1090.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((....((((((((((.(((.....((((((((((((.(((((....((((((((((((((...((((((....((((((((((.(((((.((((((((((.((..(((.(((((((((((.(((.(.(((((((........))))))).).)).).)))))).))))).)))..(((((((...))))))).......((.((((.((.........))))))..)).))))))))..))))))))).)))))).)))))))..))).))))..(((((((...))))).))..)))).))))))))))))))))))..))))).((((...((((((.(((((((.....(((((((.(((.(((((.((((((((((((((((((......)))))))..(((......))).((((.....))))(((((.....))))))))))).).)))))))))))).((((((.((((...)))).)))))).......(((........)))((((((.((.......)).))))))(((((((((.(((((.(((((((((((((((((......((((((((.((....))...))))))))(((((....)))))(((((((.((...((((((((..(((.((((((.(((((((((..(((((((((...(((((........((((.((..........))..))))..((((.((((((.((.((.(((((((((.......((((........)))).(((((.....(((((....))))).......(((((.(((((((((((((.((((((...(((((((((...((.((((..........................))))))...))).))))))))))).).))))))....)))).(((((((((((((.......)))..((((((......))))))((((((.......)))..))))))))))))).......(((((((...)))))))..)))....)))))....(((.((((..(((....)))..)))))))))))).)))))))))((((..((((((........(((.((.(((((..((((.((((((((..(((((..((((((((((.(((((..((((....((((((.((...)).))))))....))))..)))))))))).....)))))...(((((((((((.(((((((..((((((((((..((((...(((((..(.(((((((((.((((((((..(((((.....))).)).))))....((((((((((....))))))))))((((((((((....))))))).)))...((((.(((((((.(((.((.((((.(((((..((((.......))))))))).)).)).)).)))))))..(((((((((((...((((...(((((((..(((((((.......))).....(((((((......)))))))(((((....))))))))).))))).)).))))....((((((.....))))))(((..(((..(((((((((((((((..........((((.((...)).)))).............))))))(((((.((((((((((((.((((((....)))))).))).)))))).))))))))....((((......))))..(((...(((...(((...........)))..)))..)))..))))))))).))).))).)))))))))))))))))))))).))))))))).)..))))).)))).)))))..................(((.....)))((.((((((((...((((((((.((((.....)))).))..)))))).((..........))((.(((((...))))).)).((((.((((..(......)..))))))))...)))))))).))...........(((((.(((((((.......((.(((((((((.((((((.((((((((((....(((((((((..((....(((.(((.((((((((((((....((((....))))..((((.((.....)).))))....((((((((((((((((.((((.....(((((((..(((.(.(((((((.(((((..((((.(((..((((......))))))).))))..))....(((((......)))))...(((((((..((.(((.((...)).))).))..)))))..))((((((((.....)))))))))))..))))....))).).))).))))))).....((....))))))))))))))))))))))((((((..(((((((..((((..(((..((((((.((((...((((((.((.(((.(((.((((.....(((((....)))))....((...((((..((.((......)).)).))))..))...(((((.((((.(.(.(((.....(((......))).....)))..).).))))...)))))((((((.(.((..((((((..(((((.((..((((.(((........))).))))..))...........((((....)).))...((((.(((........))).)))).(((.(((((((((.......))))))))).)))......................))))))))))).)).).))))))(((((...))))))))).))).)))...((((((((.(((((.....(((((((((((((((.......(.(((((((.......(((..((((........)))).))).........(((.....)))..))))))))........((((((...((((.((((((((....)))))....))).))))...((......))))))))...(((((((.(((((...)))))....(((....)))...))..)))))......))))...))))))))))).......((....)).((((((((.(((......)))))))))))...))))).))))))))..)))))))))))).))..))))..)))..)))).))))))).......)))))).((((....(((................)))....))))))))((((((((((.(((..(((((..............((((((............))))))........((((((((((..((((((((((..(((((((((..((.(((..(((((....))))).....))).)).)))))))))........))))))).)))....))))))))))))))).))).)))))))))).)))).)))).))).....))).....))..))))))))))))))))))).))))))......(((....)))..((((.((((((...((((.((..............)).)))))))))).))))..))))))))).))......))))))).)))))))))).))))).))))))...(((....((((((((((((((((((..(((((((((..((((.(((..(((((.((((((((.....((.....))..((((((((((..((((((...(((.((((((((.(((((..((((.(((((((((...))))(((....))).(((((((((((((.(....((((.((((((.((........)))))))).............((........))..))))..).))))))).))))))))))).))))....))))).)))))....((((((....(((((...(((((..(((((((....))))))))))))..)))))......)))))).............)))))).))))))..)).)).))))))..)))))))...).))))))))))))..)))))))))..).))))))))..)))))))))..)))))))))).......)))))..))))))))......((((((((....((((((((((((((.(((...((((((.((((((.....(((((((((.((((((.(((((((((......((((((......(((........))).......))))))(((((((........))).))))))))))..)))))))))..))))))))))))))).)))))).))).)))))))))))).))))))))))....(((......)))..))))..))))))).)))......))))))..))))........)))).)))))).)))))))))..)))))))))..)).)))).)))..)))))))))...)))..)))))...)).)))))))((((....)))))))))..((((......)))))))).))))))))....)))))..)))))))))...))))))))))))))..((((((((((((.(((((..((.((((((((((...)))))).)))))).........))))).))))))))))))))))))......)))).....((((.....))))))))))))))))).....))).((((((((((.(((((..(((((.....)))))..)))..)).))))))....................((((((.....)))))).....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((....((((((((({,(({.....((((((((((((.(((((....((((((((((((((...((((((....((((((((((.(((((.((((((((((.,({,(((.(((((((((((.(((.(.(((((((........))))))).).)).).)))))).))))).)))..(((((((...)))))))...,||.({.({((,,,.......,,)))))).,)).})})))))..))))))))).)))))).)))))))..))).))))..(((((((...))))).))..)))).)))))))))))))))))).}))))).||{{..,((((((.((((((({....(((((((.((,{(((((.((((((((((((((((((......)))))))..(((......))).((((.....)))){{{{{.,,,.))))))))))).).)))))))))))}.{(((((.,(((...)))),))))}}.......(((........)))((((((.((.......)).))))))(((((((((.(((((,((((((((((((,(,((,.....((((((((.((....))...))))))))(((((....))))){((((((.((...(((((,{(..(((.((((((.{((((((((..(((((((((...(((((......,,((((,((..........}}..))))..((((.(((((,.,,,.(((({{((((((.,....,{{{....,{,.,}},..|)||..{,.(((({....}))))...,..}))))))))))...((((((.((((((...(((((((((...((.((((...{{................,,...))))))...))).))))))))))).).))))))....}}},...,,,,{(((((({....{{{{...,,,,,,}}}}.((({{||(((((({{.({{{{(..{(((,,......,,.....))))..))))))..{((((((((....,{(((,....(((.((((..(({....}))..))))))).....}))))((.((((((((((((,,...||,..,.,{{{{....,((({.{({.((((.(((...{(((((((((((({,(((((..((((....((((((.((...)).))))))....))))..)))))))))).....))))...})))))))...).)))}}))})))))},.)))))))))).))))).)))))))))))|..|||||||..(((((,.((({{.,..{{((({.((.((((((((((....))))))))))})}(((((((....))))))).{{{.....}))|{{{{,....({(({,...}}}})...,))))),....,.(((((((....))))))).})))),,((,(((({......}}))}...)))))))}.))))})))}))),.,....{((((((((,....,))},,}}}}))(((({.{((((((.....)))))).}.})))}((((({.....})))))(((....(((.{{(((((((((((,,..........,,,.,.....,.|(({.(((,,(((((...,{{({({(((,((({{((({,,{.,|||{|,,,,))}})),)))|||}}}}.,)))||}}..........,,..,..((.((((((((((..,......(((.....)))....{{{.....,,)))....,,}.,.))))|.|))))).))..))).,.))))))))).))))..((((((((({.....,{({,..........,,}|||.....|||((.((((({{{...(((((({(.((((.....)))).)}..)))))).{{..........}}((,({{{{..,)))}}.}}.(((,,((((..(......)..)))))))).,.}}}))))}|}},.((((..((((.(((((((((((.......((.(((((((((.((((((.((((((((((....(((((((((,,((,,,,,(,{(({,((((((((((((..{.{(((....))))}.((((.((.....)).))))...,((((((((((((((((.((((..,..(((((((..(((((.{,.((((.(({((..((((.(((,,(({{.,,,,.))}}))).))))..}}....(((((......)))))...(((((((..((.(((.((...}),))).)).,)))))..))((((((((.....)))))))))))..))))..,.,)),).,),.))))))).,...({....))))))))))))))))))))))|{||{{..{{{{{{,..((((,.(((.,((((.((((.....)))).{.(({(,(,(({,{|||.,{{,,{(((,..,|||||,{.,((...{(((.,((,{{......)),)).))))..)).}}||{{|,|{|{,|,|,|||.....,,{......|||,....|||..,,|{||||.,,|||||((({((.(,({..{{((((,.((((({((..((((.(((........))).))))..}}........,..((((....)).)).,,(({{.{{,....,,,.}}},}||}.(((.(((((((((.......))))))))).)))|||,...............,..}))))))}}}}.}}.},))}})}(((((...))))}},||{|||||||...{(((((((.{{(((,.....{{,|{{{|||||||.......{.(((((((.,,....{,{,,((((........)))).|||,...,}},.,{{.....}},..))))))),........((({{{...{{||,{{{(((((....)))))},,,))),))}).,,{{........))))}}({{((({{,{.(((({...}))))....||{},,.}}}.,,}}..}}})),,},,.}}}}.,,)))}}}|||||,......||,,},)).(((({{{{.||{......|}|))))))))..,||||},|||||}}}..})))))))))))|}}..}}}).,)}}.,||||.}}}}))).......})}})),|||{....{{{....,,..........))).,,,)))}))))|{{{|||{{{.|||,.{{{{{.,....,,,,|||.((((({........,...})))))..,,....((((((((((..((((((((((,{(((((((((..((.(((..(((((....))))).....))).)).))))))))}...,},..))))))),}))....))))))))))}|||}.}}),)))|||}}}}.,})),)}},.,))}}...))}}}}..))..))))))))))))))))))).))))))......,{{{,,{{{{{.((((,((({{{...({{{.{{.....,,,.,,})})),)))))})))).}}},,.))))))))).))......)))))))})))).))))))))}((((({((((((.({.,.(((((((((((((((((((..(((((((((..((((.(({.{(((((.{(((((((.....((....,)}..((((((((((..((((((...({,{((((((((.(((((..((((.((((({(({...|}}}(((..,,))).(((((((((((((.(..,,({{{.((((((.{{........}}))))}|,......,,....{{........}}..))))..).))))))).))))))))))).))))....))))).))))).,..((((((....(((((...{(({{.,(((((((....))))))))})))..))))}.....,))))))....,,....,,.)))))).))))))..)).)).))))))..)))))))...}.))))))))))))..)))))))))..),})))))))..))))))))),}.,,))..))))),...,)).)))).})))...))))))((((((((....((((((((((((((.(((...((((((.((((((.....(((((((((,,(((((.((((((((((.....{(((((......(((......},)}).......))))))|((((((........))).))))))))))..)))))))))..))))))))))))))).)))))).))).)))))))))))).)))))))))).....,....)))))))))))..,,.)))...,))),...},|})))).))}..)))))))))))))))))).)))))))))..)))))))))..)),})))})}}..))))))))).,.}},..)))))...)).))))))}((((....))))|||||{.,,,|}}.,,})))))))).))))))}.,,,.)))))..))))))))).,.))))))))))))))..((((((((((((.(((((..((.((((((((((...)))))).)))))).,.......))))).))))))))))))))))))......}}}}.....,{||,,...}}},})))))))))))).....))).{(((((((((.{{(((..(((((.....)))))..)))..}}.))))))...................,(({{{{....,))))),.....)))}

Transcripts

ID Sequence Length GC content
ACAUGACGGCGGCGGCUCCGCACGAUCCCCAGGCAGCUGUCCGCCCCCG… 4702 nt 0.5627
Summary

Members of the F-box protein family, such as FBXO10, are characterized by an approximately 40-amino acid F-box motif. SCF complexes, formed by SKP1 (MIM 601434), cullin (see CUL1; MIM 603134), and F-box proteins, act as protein-ubiquitin ligases. F-box proteins interact with SKP1 through the F box, and they interact with ubiquitination targets through other protein interaction domains (Jin et al., 2004 [PubMed 15520277]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A study in humans identified five core ferroptosis-related biomarkers for heat stroke diagnosis, with validation in peripheral blood samples showing high diagnostic efficacy [Yin et al. DOI:10.1186/s12920-025-02188-3]. A study in mice demonstrated that the FBXO10 transcript, a pro-apoptotic protein, increased in relative abundance within 0.5 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].