Basic Information
Symbol
FBXO7
RNA class
mRNA
Alias
F-Box Protein 7
FBX7
F-Box Only Protein 7
PARK15
Fbx
FBX07
PKPS
Location (GRCh38)
22:32474676-32498831
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_012179.4
Sequence length
2060.0 nt
GC content
0.5010
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-657.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-696.67 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
681.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.....))))....((((((......))))))(((((((((((.........((((((((((((.(((((...(((..(((....))))))..))))).)).......)))))))))).......))))))))))).((((((((((..(((.(((..((..(((.((((.(((.(((..((((..(((.((((((((....))))))))))).))))....))).))).)))).))).))..)))))))))))..)))))(((((((((.((((....(((((...)))))))))....((((((.((((((........................)))))....).))))))...((((.(((((((.......(((......((((((.(((((((((((.((((.....)))).))))).))).)))))))))..)))........))))))).((((..((((((((..(((((.((.(((((...(((((.......(((((..((((((((.......(((((((((.((........))..((...((((((((((.((((((......)))).)).))))))))))..)).)))))))))(((...)))...((((((((..........))))))))..........(.(((((((((((((((((((.......)))).((((.(((((..(((...(((((....(((..(((((((.((((.((((((...(((((((((......((((((..((.((.......)).)))))))))))))))))...)))).)).)))))).((((.....))))...)))))....)))....)))))..)))..)))))..))))..((.(((.(((((((((..((....))..)))))))))))).))(((((.(((...))).)))))))))))))(((((((((....((.(((((((...................))))))).))..(((((((((((...(((.((((..((.(((((..(((((.....((..(((((..((.(((((...((((.........))))....)))))))....))))).))......)))))....)))))((((((((((((((((...((((((...((((((.......))).)))..)))))).))))((((.....(((((((((......)))...)))))).....))))((((.((((((((((((((..(((((((((((((.(((.....((((.((..........((((....))))((((......))))))))))...))).))))).)))).))))....)))))).))).))))).))))......))))))))...))))........((((((((....))).))))).....))..)))).)))......)))))).......)))))..(((.(((((.((((((((((.((((((...(((((((..((((....))))....)))))))))).))).)).....((((((........))))))......(((((((.(((........((((((((((((((.........)))))).((((((.((.((.....)).))))).))).......)))))))).....((.((((((....)))))).))....((((((((...........(((((.....)))))(((((.....)))))..))))))))...))))))))))...............((((...(((((((..((.......))..)))))))....)))).))))))))(((((((((((((.((((((.(((......))))))))).))))))...............))))).))...........)))))))).....))))))))).))))))).)(((((....))))))))...)))))..)))))......)))))...)))))......)).)))))..)))..)))))..)))).....))))..........)))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{,{{.,,.,(((((((((.((((((((((((((((((((((((,.....}}}}))}.,,,,((((((((((((..(((((((,,,..,,,.,,|||||||{{,({{(,..,{{(((((({(({{...|||||||}||,|(,({((((({.{((((((({{,({{((({(((({((({(((,{({((,.{{,.,,|||,||}}..)))))}})))).),)).)}}))},,))}))))})}}.},}}))),),))})).})))))...{||,{{|{{{{..}}||||{..,}}|}}||||,.{{((((((.{((((({{{{{{{{{{{{...{{{.,{{{{||,...,,{((,{(,{{,,...{{{{,({{,{.,.,,,|{{{|,,,...((({{{((((((((((,,{{((,((((((((.{{{,|,,{{(((,..,,,,{,.............||}||,.,}||,|||||||||||,.,.}}}}}))}....||||},|||,,,.,||||,..{{{{|{{,.....(((((((((.({.,......}}..{{...((((((((((.((((((......))))},).))))))))))..,}.))))))))){{{{{{|,,...{{{|||||,.,|.,,},.}))))))}..,{{,|....,))|,((((((..(({((((.......})))})..)))))),,.,}}},,,{|||,|{{((({{{.||,.{{{{{{{{{((({...,((,{{{,,..|,..,|||||}}}}}},.,}}}..))}}})},,||||}}}}))),..||||,|||||}||{{{((((...,.(({,((({{{({{..{,....,{(({.{{(.....))),.})})|..{{.(((.(((((((((..((....))..)))))))))}}}.|}{{{{|.|||,,,))).)))))...,}.))))))),))}.}})))))}|((((((,....||||{,....,{|}}},,},})),|,{,||||||{...{{|,||||,.((.,((({..(((((,..,,{,..{{{{|..{|.||||{...{|||,,..,,,,,)}))....))))))),,,}}}))).|{{{{{{,||||,{{{{,,||,,...||,|{,|}||||,,.((((((...((((((.......))).)))..)))))).|||},{({.......|||,|,|......{||{...))))....(((...((((.((((((((((((((..(((((((((((((.(((.....((((.((.......{{{((((....)))),|||,.........))))))...))).))))).)))).))))....)))))).))),,)))).))))....))))))))))}.....,..,..,..{(((((((....))).))))},||,,||..}})).))),.,...})}}})...,,..,}}},..,,.,,)))))|)))}|||||,}......,}}|||{((||(({(..,.||||.....{{((((((((.(((.......((((((........))))))........))))))))),.......((((((((((((((.........)))))).((((((.((.((.....)).)))))},)).......))))))))...}}}}.,..,,}},)))})})))))},,,{(((((((....,,,....{{(((....,))}||(((((.....))))))})))))))}...|}}|||||..,,......)),.,}}|||}}}.(((((((.,((,.....,))..))))))).,,.}}}).,))))},}},,,,||||||||.|||,,,.}}}}}.}}})))}}))))}),))))})))....{,,....}}},,.........}}.,.))))))))).))}((({{{((({{{(,,......)))..})))))))).)))),})))))),......}))))))))))),}}},,,},)}.,,.|||,,.{{{(.((((.(((.......))))})}.}}},.,..........
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| ACGGGAGGCCCGGGCUCUUCCGGGCGUCGCGGAGCCGGAGGGUGCAGGC… | 1725 nt | 0.4899 | |
| ACGGGAGGCCCGGGCUCUUCCGGGCGUCGCGGAGCCGGAGGGUGCAGGC… | 1877 nt | 0.4832 | |
| GCUCUAUUCCAGAGACCGAGUGGCAGGGCGGCCACUGUGGCGGGGCUCU… | 2060 nt | 0.5010 |
Summary
This gene encodes a member of the F-box protein family which is characterized by an approximately 40 amino acid motif, the F-box. The F-box proteins constitute one of the four subunits of the ubiquitin protein ligase complex called SCFs (SKP1-cullin-F-box), which function in phosphorylation-dependent ubiquitination. The F-box proteins are divided into 3 classes: Fbws containing WD-40 domains, Fbls containing leucine-rich repeats, and Fbxs containing either different protein-protein interaction modules or no recognizable motifs. The protein encoded by this gene belongs to the Fbxs class and it may play a role in regulation of hematopoiesis. Alternatively spliced transcript variants of this gene have been identified with the full-length natures of only some variants being determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.