Basic Information

Symbol
FBXW7
RNA class
mRNA
Alias
F-Box And WD Repeat Domain Containing 7 SEL-10 SEL10 FBX30 FBW7 FBXW6 CDC4 AGO F-Box And WD Repeat Domain Containing 7, E3 Ubiquitin Protein Ligase F-Box And WD-40 Domain Protein 7 (Archipelago Homolog, Drosophila) F-Box/WD Repeat-Containing Protein 7 F-Box Protein FBX30 FLJ11071 HCdc4 HAgo F-Box And WD-40 Domain-Containing Protein 7 Archipelago Homolog (Drosophila) Homolog Of C Elegans Sel-10 F-Box Protein SEL-10 Archipelago Homolog F-Box Protein FBW7 Archipelago DEDHIL FBXO30 FBW6
Location (GRCh38)
4:152320544-152536107
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001349798.2
Sequence length
5639.0 nt
GC content
0.4566

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1793.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1906.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1543.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001013415.2 NCBI
GCACUUCACCAAGCCUCAGACAGGUCAGGACAUUUGGUAGGGGAAGGUU… 4301 nt 0.3874
NM_001257069.1 NCBI
GGAAACUUUACAAAAACAAAAUCCGGAGUCUCCCAAACCUGACUGUCCC… 989 nt 0.4388
NM_001349798.2 NCBI
CUCUCUGGAGUGAGGCGAGAGCCCCGCACAGAGCGAGGGAGACAGCGAG… 5639 nt 0.4566
NM_018315.5 NCBI
AGUCAAGGCUUUGACAGGGCAUAGUCUCCUCCAAUAAUCUUCUCCGUUC… 4317 nt 0.3910
NM_033632.3 NCBI
UACCGCGCCGGAGCCUUCCGCAGCUGCCGCUUCAGUCCGAAGGAGGAAG… 3927 nt 0.4074
Summary

This gene encodes a member of the F-box protein family which is characterized by an approximately 40 amino acid motif, the F-box. The F-box proteins constitute one of the four subunits of ubiquitin protein ligase complex called SCFs (SKP1-cullin-F-box), which function in phosphorylation-dependent ubiquitination. The F-box proteins are divided into 3 classes: Fbws containing WD-40 domains, Fbls containing leucine-rich repeats, and Fbxs containing either different protein-protein interaction modules or no recognizable motifs. The protein encoded by this gene was previously referred to as FBX30, and belongs to the Fbws class; in addition to an F-box, this protein contains 7 tandem WD40 repeats. This protein binds directly to cyclin E and probably targets cyclin E for ubiquitin-mediated degradation. Mutations in this gene are detected in ovarian and breast cancer cell lines, implicating the gene's potential role in the pathogenesis of human cancers. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2012] CIViC Summary for FBXW7 Gene

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the FBXW7 peptide FBXW7-185aa, originating from circ-FBXW7, inhibits cell cycle progression [Misir et al. DOI:10.1038/s41418-022-00948-7]. In human brain cancer, the FBXW7 functions as a tumor suppressor, where its translated peptide reduces the half-life of c-Myc, and its expression inhibits cell progression, migration, and tumor formation [Di Agostino et al. DOI:10.3389/fcell.2020.00389].