Basic Information

Symbol
FBXW9
RNA class
mRNA
Alias
F-Box And WD Repeat Domain Containing 9 MEC-15 Fbw9 F-Box And WD-40 Domain-Containing Protein 9 F-Box/WD Repeat-Containing Protein 9 F-Box And WD-40 Domain Protein 9 MGC10870 F-Box And WD-40 Repeat Containing Protein 9 Specificity Factor For SCF Ubiquitin Ligase FBW9
Location (GRCh38)
19:12688053-12696649
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032301.3
Sequence length
1727.0 nt
GC content
0.6358

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-776.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -800.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 438.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_032301.3 NCBI
GUGCUGCCUAGGAGACAAGACGCGAGGCCGGCAGCGCCCACCCGGUCGC… 1727 nt 0.6358
Summary

Members of the F-box protein family, such as FBXW9, are characterized by an approximately 40-amino acid F-box motif. SCF complexes, formed by SKP1 (MIM 601434), cullin (see CUL1; MIM 603034), and F-box proteins, act as protein-ubiquitin ligases. F-box proteins interact with SKP1 through the F box, and they interact with ubiquitination targets through other protein interaction domains (Jin et al., 2004 [PubMed 15520277]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the FBXW9 gene was downregulated as part of the inhibited protein folding pathway in the lungs and brain of sepsis patients compared to uninfected controls, based on RNA sequencing of post-mortem tissue samples [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].