Basic Information

Symbol
FCAR
RNA class
mRNA
Alias
Fc Alpha Receptor CD89 FcalphaRI FcalphaR Fc Fragment Of IgA, Receptor For Immunoglobulin Alpha Fc Receptor Fc Fragment Of IgA Receptor IgA Fc Receptor CD89 Antigen CTB-61M7.2
Location (GRCh38)
19:54874235-54891420
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002000.4
Sequence length
2476.0 nt
GC content
0.4572

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-758.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -804.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 532.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002000.4 NCBI
AUCCUGCUAAUGUGCAUUGAAAGGAGAGCAACGGGGCUGAGGCCGUGUC… 2476 nt 0.4572
NM_133269.4 NCBI
AUCCUGCUAAUGUGCAUUGAAAGGAGAGCAACGGGGCUGAGGCCGUGUC… 2410 nt 0.4544
NM_133271.4 NCBI
AUCCUGCUAAUGUGCAUUGAAAGGAGAGCAACGGGGCUGAGGCCGUGUC… 2188 nt 0.4470
NM_133272.4 NCBI
AUCCUGCUAAUGUGCAUUGAAAGGAGAGCAACGGGGCUGAGGCCGUGUC… 2440 nt 0.4553
NM_133273.4 NCBI
AUCCUGCUAAUGUGCAUUGAAAGGAGAGCAACGGGGCUGAGGCCGUGUC… 2152 nt 0.4447
NM_133274.4 NCBI
AUCCUGCUAAUGUGCAUUGAAAGGAGAGCAACGGGGCUGAGGCCGUGUC… 2366 nt 0.4518
NM_133277.4 NCBI
AUCCUGCUAAUGUGCAUUGAAAGGAGAGCAACGGGGCUGAGGCCGUGUC… 2149 nt 0.4500
NM_133278.4 NCBI
AUCCUGCUAAUGUGCAUUGAAAGGAGAGCAACGGGGCUGAGGCCGUGUC… 2374 nt 0.4524
Summary

This gene is a member of the immunoglobulin gene superfamily and encodes a receptor for the Fc region of IgA. The receptor is a transmembrane glycoprotein present on the surface of myeloid lineage cells such as neutrophils, monocytes, macrophages, and eosinophils, where it mediates immunologic responses to pathogens. It interacts with IgA-opsonized targets and triggers several immunologic defense processes, including phagocytosis, antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity, and stimulation of the release of inflammatory mediators. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.