Basic Information

Symbol
FCGR2B
RNA class
mRNA
Alias
Fc Gamma Receptor IIb CD32 FcgammaRIIb FcGRIIB CD32B FCG2 Fc Fragment Of IgG, Low Affinity IIb, Receptor For (CD32) Low Affinity Immunoglobulin Gamma Fc Region Receptor II-B Fc Fragment Of IgG, Low Affinity IIb, Receptor (CD32) Fc Fragment Of IgG Receptor IIb IgG Fc Receptor II-B Fc-Gamma RII-B Fc-Gamma-RIIb FcRII-B FCGR2 IGFR2 CDw32 Low Affinity Immunoglobulin Gamma Fc Region Receptor II-C Fc Fragment Of IgG, Low Affinity II, Receptor For (CD32) IgG Fc Receptor II-C Fc-Gamma RII-C Fc Gamma RIIb Fc-Gamma-RIIc CD32 Antigen FcRII-C FCGR2C
Location (GRCh38)
1:161662803-161679490
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001394477.1
Sequence length
2133.0 nt
GC content
0.4632

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-685.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -725.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 647.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((......(((((((....))))))).((((((((((((((((((..(((((((...((((((((((((((((((((.(((((..((((((((((((...))))))))))))..(((((.(((((..((((.(((.((((((((.(((..((((((((..((.(((((((((((.((((.((.((..((((((.....(((((((.......))))))).....))))))..)))).)))).((......))..(((((((..((((.((...)).)))))).)).))))))))))))))...)).))))))))..)))...((.((((.(((......))).))))))...(((((((...)))))))........)))))))).)))...)))).))).......)).))))).((((((((((.((..((((...(((((....((....))....))).)).))))))))))))))))))))))))))))).))))).((((..(((((....)))))))))....(((.((.....)))))).))))))((((((((..(((((..((((((((((((.....(((.(((((((((((.......))))).))))))))).............((((((.......(((((((((((((((((.....((........))...((((((((..................)))))))).(((((..((....((((...))))...))..)))))..)))))))))))))))))...))))))(((.((((((((....)))))))).)))))))))))))))..((((........)))).((((((((((((((.....(((((....)))))...)))))))).......))))))...(((((.(((...........)))..)))))........(((((((((((.................)))))).)).)))(((((((((((((((((((..(.....((((.(((....((((((.(((((((.(...((((((((.(..((((((((((.........)))))).))))....).))))))))......).)))))))))))))..))).))))......)..))).))))))))))).)))))...((((((..((((.........(((((.((.(((((......((((..........))))......))))))))))))..))))..))).))))))))..))).)))))......)))))))................(((.((((((((.....))))))))...)))......(((((((........)))))))...(((((((((....))))))))).(((((.((((....((((......))))((((.(((...........)))..))))((((((.........(((((((((((...............))))))))))).))))))(((((((((.....)))))))))..)))))))))......)))))))))))....))).))))..((((......)))))))))))))(((((((......)).))))).....(.(((((((...........(((((((((((((((((((.((((((((..(((((((((((.((((((((((...((..(((((...((((((....((((((((((((..((((.(((....)))))))..))).)))).)))))...........................(((((((((....((((..(....)..))))....(((((((((..((((((...)))).))....))))))))))))))))))...))))))..)))))..))...))))))..((((((.........))))))((((((........))))))....((((..........))))((.((..((((.....))))..)).)).((((((.....((((((......))))))....)))))).......))))))))))............))))).)))))))).)).)))))))))))).))))).............))))))).).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
......(((..{(((((((((,...,|{{|||..,|{{{,.((((((.,,,.}}||||{{{,,.({{((({{{{{|||||||||,})).|,,|(((((((((((...))))))))))),.((((((((((((.((((((((..,,((((((..((..((((((((,.((.(((((((((((.((((.((.((..((((((,....(((((((.......)))))))....,))))))..)))).)))),|,......,}..(((((((..((((.({...}).)))))).)).))))))))))))))...)).))))))))}})))))){(.((((.(((......))).))))}}...{((((((...))))))|{{{.{{.{{{(..{{(({{{{{,.,||,||{{{,{..{{,,,{{{{{(((((((((((((({({...|||,......{(({{..,....(((((({...{(((((((.{({{(..((((((((.(((((((.........))))))).)))){{.((((({,{{.,,..,,{|,}},,.,.))))((((((((...((((...,,..}))},...}))}}}}}(((((((((((.......)))))})}))))||,..,,...}))))).|})))).}).))}.)))))))},((((((....)))))))))))))...,.,})))}.,))).))))))).})).,|((|(((((,{,{,..|{{{(({.(((({.,{,......),))))}}.,,}}}||||||||}}|,}||||{|{(({((((((((....)))))))|{|||||||}}}}}},)},||||}}......}}||.{{{{{(((((((((.....(((((....)))))...))))))))...,,,.)}))),..,{{|{{||||,,,.....,,,}},.,))|}}........(((((((((((...,,,.....,,,...)))))).)).)))(((((..,(((((((((((((((...,{{{,.{,.....(((,(({.(((...})}.)))}}}|{({{,,{{...|{{(({.((({{..,,,{{{.,,,,...})}....}))))}}},}}.|{((((((((|.,,{|.|{|,,|.....,,{{||,,,,)))}},||,{||,,,...))},}})}).}))))))))))}|({{{({{(((((.....,((((..........)))),.....)))))))))),,.,})))),),)))),})))))))))}.....}}}}}.}}))))),...,,,,........,,,,((((((({...,,))))))}}.,,)))}....,{{{{{||,,,,}},,||||||}...,{||||||{,,,,}}}}})))).((({{{((({....((((......)))}((((.(({{{.....}),,}))..)))){{{{{{..,,||...{{(({{{{(((...,,,,,.......)))))))))))..,,,,.{((((((((.....))))))))}..}))}))))).....,||,,,}})))))}})))))))),.})))).)))..)))),)))))},,,,,{(((.,,...}}.)))))))))))..,)))))....}))))))(((((((((((((((((((.((((((((..(((((((((((.((((({.....,,{.....,,,|,,,{{(({{,..((((((((({{{,,(({{,(((....,}}}))),,))).)))).)))))............{{{{{{{........,|||||||,....{{((..,.,..,..)))}....(((((((((..,(((((...))))}.)....)))))))))((((((({...}))))))),{((,{{{||{{{|,,,,,..}}}|}}}}}.}}|{{{(((({((((((........))))))...))))}}}}},...},},,,|{.,{..((({.....)}))..,,.}}.((((((.....((((((......))))))....)))))),)}}}))))))))))))............))))).)))))))).))))))))))))))))))))))))))))))}...))),,,,.........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001002273.3 NCBI
GCAGACCAAGUGGCUUAAGGGUAGAAUCCGCCAAGCUUUGAGAGAAGGC… 2065 nt 0.4605
NM_001002274.3 NCBI
GCAGACCAAGUGGCUUAAGGGUAGAAUCCGCCAAGCUUUGAGAGAAGGC… 2068 nt 0.4608
NM_001002275.3 NCBI
GCAGACCAAGUGGCUUAAGGGUAGAAUCCGCCAAGCUUUGAGAGAAGGC… 2122 nt 0.4637
NM_001190828.2 NCBI
GCAGACCAAGUGGCUUAAGGGUAGAAUCCGCCAAGCUUUGAGAGAAGGC… 2104 nt 0.4625
NM_001386000.1 NCBI
GCAGACCAAGUGGCUUAAGGGUAGAAUCCGCCAAGCUUUGAGAGAAGGC… 2101 nt 0.4622
NM_001386001.1 NCBI
GCAGACCAAGUGGCUUAAGGGUAGAAUCCGCCAAGCUUUGAGAGAAGGC… 2047 nt 0.4592
NM_001386002.1 NCBI
GCAGACCAAGUGGCUUAAGGGUAGAAUCCGCCAAGCUUUGAGAGAAGGC… 2044 nt 0.4589
NM_001386003.1 NCBI
GCAGACCAAGUGGCUUAAGGGUAGAAUCCGCCAAGCUUUGAGAGAAGGC… 2087 nt 0.4633
NM_001386004.1 NCBI
GCAGACCAAGUGGCUUAAGGGUAGAAUCCGCCAAGCUUUGAGAGAAGGC… 2063 nt 0.4615
NM_001386005.1 NCBI
GCAGACCAAGUGGCUUAAGGGUAGAAUCCGCCAAGCUUUGAGAGAAGGC… 2030 nt 0.4601
Showing 1 to 10 of 13 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a low affinity receptor for the Fc region of immunoglobulin gamma complexes. The encoded protein is involved in the phagocytosis of immune complexes and in the regulation of antibody production by B-cells. Variations in this gene may increase susceptibilty to systemic lupus erythematosus (SLE). Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2010] CIViC Summary for FCGR2B Gene

Forensic Context

A study in C57BL/6J mice using a closed head weight-drop model demonstrated that mild traumatic brain injury induces significant transcriptional upregulation of the FCGR2B in the ipsilateral neocortex three days post-injury, with a 3.0-fold increase, indicating its role in the inflammatory and immune response to neural trauma [Israelsson et al. DOI:10.1089/neu.2008.0676].