Basic Information

Symbol
FFAR2
RNA class
mRNA
Alias
Free Fatty Acid Receptor 2 FFA2R GPR43 G-Protein Coupled Receptor 43 Free Fatty Acid Activated Receptor 2 G Protein-Coupled Receptor 43 Fatty Acid Receptor 2 GPCR43 FFA2
Location (GRCh38)
19:35443907-35451767
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Sudden death from respiratory system disease
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001370087.1
Sequence length
2177.0 nt
GC content
0.5370

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-808.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -845.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 649.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001370087.1 NCBI
ACCAUUUUUUCCUGCAUGGCAUGGACAGAAGCAGGGGCUAAAGCUCUGU… 2177 nt 0.5370
NM_005306.3 NCBI
ACCAUUUUUUCCUGCAUGGCAUGGACAGAAGCAGGGGCUAAAGCUCUGU… 2300 nt 0.5374
Summary

This gene encodes a member of the GP40 family of G protein-coupled receptors that are clustered together on chromosome 19. The encoded protein is a receptor for short chain free fatty acids and may be involved in the inflammatory response and in regulating lipid plasma levels. [provided by RefSeq, Apr 2009]

Forensic Context

A single-cell transcriptomic analysis in a rat model of radiation-induced lung injury identified the FFAR2 as an orthologous rat gene associated with inflammatory processes [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357].