Basic Information

Symbol
FGB
RNA class
mRNA
Alias
Fibrinogen Beta Chain Fibrinogen, B Beta Polypeptide Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Li 78p Beta-Fibrinogen HEL-S-78p
Location (GRCh38)
4:154562971-154572807
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005141.5
Sequence length
3641.0 nt
GC content
0.4122

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-931.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1004.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1027.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001184741.1 NCBI
AGAUAUAUAUAGGAUUGAAGAUCUCUCAGUUAAGUCUACAUGAAAAGGA… 3451 nt 0.4028
NM_001382759.1 NCBI
AAGUCUACAUGAAAAGGAUGGUUUCUUGGAGCUUCCACAAACUUAAAAC… 3509 nt 0.4109
NM_001382760.1 NCBI
AAGUCUACAUGAAAAGGAUGGUUUCUUGGAGCUUCCACAAACUUAAAAC… 3443 nt 0.4092
NM_001382761.1 NCBI
AAGUCUACAUGAAAAGGAUGGUUUCUUGGAGCUUCCACAAACUUAAAAC… 3551 nt 0.4114
NM_001382762.1 NCBI
AAGUCUACAUGAAAAGGAUGGUUUCUUGGAGCUUCCACAAACUUAAAAC… 3341 nt 0.4119
NM_001382763.1 NCBI
AAGUCUACAUGAAAAGGAUGGUUUCUUGGAGCUUCCACAAACUUAAAAC… 3632 nt 0.4119
NM_001382764.1 NCBI
AAGUCUACAUGAAAAGGAUGGUUUCUUGGAGCUUCCACAAACUUAAAAC… 3504 nt 0.4101
NM_001382765.1 NCBI
AAGUCUACAUGAAAAGGAUGGUUUCUUGGAGCUUCCACAAACUUAAAAC… 3617 nt 0.4117
NM_005141.5 NCBI
AAGUCUACAUGAAAAGGAUGGUUUCUUGGAGCUUCCACAAACUUAAAAC… 3641 nt 0.4122
Summary

The protein encoded by this gene is the beta component of fibrinogen, a blood-borne glycoprotein comprised of three pairs of nonidentical polypeptide chains. Following vascular injury, fibrinogen is cleaved by thrombin to form fibrin which is the most abundant component of blood clots. In addition, various cleavage products of fibrinogen and fibrin regulate cell adhesion and spreading, display vasoconstrictor and chemotactic activities, and are mitogens for several cell types. Fibrinogen serves key roles in hemostasis and antimicrobial host defense. Mutations in this gene lead to several disorders, including afibrinogenemia, dysfibrinogenemia, hypodysfibrinogenemia and thrombotic tendency. [provided by RefSeq, Aug 2020]

Forensic Context

A study in human blood plasma demonstrated that the FGB (Fibrinogen beta chain) was significantly upregulated with age and was used as a protein biomarker for age prediction [Salignon et al. DOI:10.18632/aging.204787]. In human serum exosomes from septic patients, the FGB was identified as a differentially expressed protein upregulated during sepsis progression and associated with coagulation cascades [Li et al. DOI:10.1016/j.jare.2021.11.005].