Basic Information

Symbol
AKAP12
RNA class
mRNA
Alias
A-Kinase Anchoring Protein 12 AKAP250 SSeCKS Src-Suppressed C Kinase Substrate A Kinase (PRKA) Anchor Protein 12 A-Kinase Anchor Protein 12 Gravin A Kinase (PRKA) Anchor Protein (Gravin) 12 Myasthenia Gravis Autoantigen Gravin A-Kinase Anchor Protein, 250kDa A-Kinase Anchor Protein 250 KDa Kinase Scaffold Protein Gravin Myasthenia Gravis Autoantigen AKAP 250 AKAP-12
Location (GRCh38)
6:151239936-151358563
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005100.4
Sequence length
8466.0 nt
GC content
0.4627

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2569.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2727.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1959.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001370346.1 NCBI
AAGCGGCAGUUCGCCCCGCAGCGAUGGCGGACACGGAAUCCCGAGGGCC… 7956 nt 0.4500
NM_005100.4 NCBI
GGAGUUAAACACAAUCUGCAGGAAAGCAAAUGGGGACUCGGACUCGCUC… 8466 nt 0.4627
NM_144497.2 NCBI
GUGCGGCCCGGGCGGGGAAGUUUGCGCUCCCGAAGUCCUGGAGCUCAGC… 8246 nt 0.4555
Summary

The A-kinase anchor proteins (AKAPs) are a group of structurally diverse proteins, which have the common function of binding to the regulatory subunit of protein kinase A (PKA) and confining the holoenzyme to discrete locations within the cell. This gene encodes a member of the AKAP family. The encoded protein is expressed in endothelial cells, cultured fibroblasts, and osteosarcoma cells. It associates with protein kinases A and C and phosphatase, and serves as a scaffold protein in signal transduction. This protein and RII PKA colocalize at the cell periphery. This protein is a cell growth-related protein. Antibodies to this protein can be produced by patients with myasthenia gravis. Alternative splicing of this gene results in two transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans identified the AKAP12 as a diagnostic and prognostic biomarker for neonatal sepsis, with its serum levels being elevated in affected patients [Li et al. DOI:10.1038/s41598-025-99619-z].