Basic Information

Symbol
FGF1
RNA class
mRNA
Alias
Fibroblast Growth Factor 1 AFGF ECGF Heparin-Binding Growth Factor 1 ECGF-Beta FGF-Alpha GLIO703 ECGFA ECGFB HBGF1 FGFA Endothelial Cell Growth Factor, Alpha Endothelial Cell Growth Factor, Beta Fibroblast Growth Factor 1 (Acidic) HBGF-1 FGF-1 Beta-Endothelial Cell Growth Factor Acidic Fibroblast Growth Factor Endothelial Cell Growth Factor
Location (GRCh38)
5:142592166-142698070
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000800.5
Sequence length
3748.0 nt
GC content
0.4368

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1105.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1177.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 942.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000800.5 NCBI
AGAGCUGCAGUAGCCUGGAGGUUCAGAGAGCCGGGCUACUCUGAGAAGA… 3748 nt 0.4368
NM_001144892.3 NCBI
ACUGUUGGCAGCAGCACAAUGUUUGGGCUAAGACCUGGUCUUGAAAGCG… 3652 nt 0.4329
NM_001144934.2 NCBI
GUGGGCAUACCAGUGUCAGCUGCACUUGUAGGGGCCCAAGUGCCUCAUG… 3817 nt 0.4399
NM_001144935.2 NCBI
GUGGGCAUACCAGUGUCAGCUGCACUUGUAGGGGCCCAAGUGCCUCAUG… 3723 nt 0.4367
NM_001257205.1 NCBI
ACAUGAGAGGGGGAGAAAUAAAUAUACAGUGCUUGUCCUUAGCCUUUCU… 4072 nt 0.4435
NM_001257206.2 NCBI
GUGGGCAUACCAGUGUCAGCUGCACUUGUAGGGGCCCAAGUGCCUCAUG… 4011 nt 0.4448
NM_001257207.2 NCBI
AGAAGUCCAUUCGGCUCACACAUUUGCCCCAAGACAAACCACGUUAAAA… 3806 nt 0.4372
NM_001257208.2 NCBI
AGUUUAGAGACUGCAAAAAUAUGAAUGCACCAUGCCGCCACAUUAUCUC… 3781 nt 0.4361
NM_001257209.1 NCBI
AGACAUGUAAAAAUAGUACUUCUAGUUUAGAGACUGCAAAAAUAUGAAU… 3828 nt 0.4347
NM_001257210.2 NCBI
AACUCAGUGAGGCAACCAGGCAGUGGGGCCGGCUGGCCAGACUCUUGGG… 3741 nt 0.4376
Showing 1 to 10 of 27 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the fibroblast growth factor (FGF) family. FGF family members possess broad mitogenic and cell survival activities, and are involved in a variety of biological processes, including embryonic development, cell growth, morphogenesis, tissue repair, tumor growth and invasion. This protein functions as a modifier of endothelial cell migration and proliferation, as well as an angiogenic factor. It acts as a mitogen for a variety of mesoderm- and neuroectoderm-derived cells in vitro, thus is thought to be involved in organogenesis. Multiple alternatively spliced variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jan 2009]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that blast wave exposure induced a complex vascular wound healing response, with fibroblast growth factor 1 (Fgf1) mRNA expression elevated at 24 hours after a 10–11 psi blast and at all time points following a 14–15 psi exposure [Balaban et al. DOI:10.1016/j.jneumeth.2016.02.001]. In a mouse model of contusion spinal cord injury, FGF1 mRNA was identified as a factor for neuroprotection and regeneration, with its expression declining post-injury and being dynamically related to specific long noncoding RNAs in a constructed network [Ding et al. DOI:10.1155/2016/9249401]. A study in rabbits demonstrated that the expression of the FGF1 mRNA in microwave burn wound tissue was significantly increased 12 hours post-burn, peaked at 48 hours, and gradually decreased by 96 hours [Li et al. DOI:10.007/s11596-007-0525-z].