Basic Information

Symbol
FGF12
RNA class
mRNA
Alias
Fibroblast Growth Factor 12 FHF1 Fibroblast Growth Factor Homologous Factor 1 Myocyte-Activating Factor FGF12B Fibroblast Growth Factor FGF-12b Fibroblast Growth Factor 12B EIEE47 FGF-12 DEE47 FHF-1
Location (GRCh38)
3:192139390-192767764
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from CNS diseases Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004113.6
Sequence length
5353.0 nt
GC content
0.3378

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1241.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1356.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1149.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001377292.1 NCBI
ACUACACCUGCAGCACCACGCUCGGAGGACAGCUCCUGCCUGCAGCUUC… 5242 nt 0.3342
NM_001377293.1 NCBI
ACUACACCUGCAGCACCACGCUCGGAGGACAGCUCCUGCCUGCAGCUUC… 5210 nt 0.3324
NM_001377294.1 NCBI
ACUUCCUUCCUCGGCCGGGAUGGGCGGCGCGGGACUGAGUGAUCGGCCU… 5238 nt 0.3345
NM_004113.6 NCBI
ACUACACCUGCAGCACCACGCUCGGAGGACAGCUCCUGCCUGCAGCUUC… 5353 nt 0.3378
NM_021032.5 NCBI
ACUUCCUUCCUCGGCCGGGAUGGGCGGCGCGGGACUGAGUGAUCGGCCU… 6725 nt 0.3990
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the fibroblast growth factor (FGF) family. FGF family members possess broad mitogenic and cell survival activities, and are involved in a variety of biological processes, including embryonic development, cell growth, morphogenesis, tissue repair, tumor growth, and invasion. This growth factor lacks the N-terminal signal sequence present in most of the FGF family members, but it contains clusters of basic residues that have been demonstrated to act as a nuclear localization signal. When transfected into mammalian cells, this protein accumulated in the nucleus, but was not secreted. The specific function of this gene has not yet been determined. [provided by RefSeq, Dec 2019]

Forensic Context

A study in human traumatic brain injury (TBI) patients demonstrated that FGF12 (Fibroblast growth factor 12) mRNA was identified as a differentially expressed biomarker, forming part of a positively correlated lncRNA-mRNA pair in a co-expression network and appearing within the MAPK signaling pathway [Yang et al. DOI:10.4103/1673-5374.247467]. A study in rats demonstrated that blast-induced mild traumatic brain injury primarily involves vascular injury, with mRNA expression analysis revealing blast intensity- and time-dependent changes in vascular wound healing markers, including upregulation of fibroblast proliferation factors like Fgf1, Fgf2, and Fgfr3 after higher magnitude exposures [Balaban et al. DOI:10.1016/j.jneumeth.2016.02.001].