Basic Information

Symbol
FGF5
RNA class
mRNA
Alias
Fibroblast Growth Factor 5 Heparin-Binding Growth Factor 5 Smag-82 HBGF-5 TCMGLY FGF-5
Location (GRCh38)
4:80266639-80336680
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004464.4
Sequence length
5313.0 nt
GC content
0.3659

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1333.47 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1438.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1315.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001291812.2 NCBI
AGUAGGGCCAGAUCGCUCUUCCAGCGCGGGUUGGUCCACCAGGCAGAGC… 5098 nt 0.3545
NM_004464.4 NCBI
GCUCGGGUGGCCUCUCUCUUCCCCUCUCCCCUUCUCUUCCCCGAGGCUA… 5313 nt 0.3659
NM_033143.2 NCBI
GGGGAAGCUUCGCAGGCGUGCACGGAGCAGUGAGAUCACUGGCGUUAUA… 5295 nt 0.3685
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the fibroblast growth factor (FGF) family. FGF family members possess broad mitogenic and cell survival activities, and are involved in a variety of biological processes, including embryonic development, cell growth, morphogenesis, tissue repair, tumor growth and invasion. This gene was identified as an oncogene, which confers transforming potential when transfected into mammalian cells. Targeted disruption of the homolog of this gene in mouse resulted in the phenotype of abnormally long hair, which suggested a function as an inhibitor of hair elongation. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice and humans demonstrated that alleles associated with elevated plasma FGF5 levels demonstrate a significant reduction in the risk of cardiovascular diseases, and there are cardioprotective effects in pig models [Wang et al. DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143171].