Basic Information

Symbol
FGF8
RNA class
mRNA
Alias
Fibroblast Growth Factor 8 AIGF Androgen-Induced Growth Factor Fibroblast Growth Factor 8 (Androgen-Induced) Heparin-Binding Growth Factor 8 HBGF-8 FGF-8 KAL6 HH6
Location (GRCh38)
10:101770109-101780371
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_033163.5
Sequence length
1169.0 nt
GC content
0.6424

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-522.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -541.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 309.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((..(((((...(((((.(((((..((((....(((((((.(((((((.(((((((((((.(((...))).)))...)))))))).)))))))(((....)))...))))))).....)))).))))))))))...((((((.((((((((....)))))))).))))))....)))))(((((.((.((((((((((((.((((((((..((((((.((((((((((.(..((((((((((((((.((((((((((((((((((....(((......)))..)))))))((((..((.((((((((((((.....))))))).))))))).))))((((((((...)).).)))))..(((((..((((((...((((((.................)))))))))))).))))).....))))))))((((((((((((((....((((((....((.......((((....)))).......))..))))))..((((....(((......)))..)))).)))).))))).(((((((((...))...(((((.((((((((..(((((....))))).....))))).((((((......)).))))...))).)))))....)))))))..))))).....))).))))))))..)))).))..).)))......)))))...((((((.............)))))).(((...)))......)).))))))...))))))......((....))))))))))))...)))).)).))).))((((((..(..(((((((....)))))))..)..)))))).(((((........)).))).((((.((.(((((...(((.................)))...))))))))))).((((((((.(.((((((((((((((.(((.((....)).)))....(((((((((((...(((.(((..((((...((((((((.(((.(((.........)))..))).)))))))).....))))))))))...)))))))).))).)))).)))).))))))))))))))).........)))))))).........(((((((((((.((((........)))).))))))))))).................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.((((((((.,(((((...(((((.(((((..((((....(((((((.(((((((.(((((((((((.(((...))).)))...)))))))).)))))))(((....)))...))))))).....)))).)))))))))}..,((((((.((((((((....)))))))).)))))).,.,}}}||(((((,((,(((((((((({({{((((((({,{((({{.{{({{{({({,{.|((((((((((((((.(((({{((((((((((({,,..{{{,.||,.{(((((((((((((((((((.,.,,))||||,.......))))))}}))))))}{{||(((({((,..,}|,|,}}|}}..(((((..((((((...((((((.................)))))))))))).))))),,|.,|(||||||{..,|{{{{||{{{..,.((((((..,..,.......((((....))))...},..,)}.)))))).}|||{....(((......)))..,))),)))),)|||}.(((((((,,...},...(((((.(({(((((.,(((((....)))))...,.))))).(({(((......)))})))...))).)))))....)))))))..)))}},}}.}))).)))))))),.,)))}.}..},|||{{,,..,||||...((((((,,{.....,,.,.)))))).{{.,,,.||{,.{{,|}.}}}}}},),),)))).,}}.{((....)))}}}}}||}}...)))),)),))),))||{(((..|..(((((((....)))))))..),,))}))),|||||,.......,,.}}}.((((.({{(((((...(((..............,..}}}...))))))))))),||{(((((.{.(({(({(({{{{{{,(((,{{....)).))).|{{(((((((((((...(({{(((..((((.,.((((((((.(((.(((.........)))..))).))))))))...,.))))))))))...)))))))).)))))))),)))).))))))))))))}}}.........)))))))).,....,..(((((((((((.((((........)))).))))))))))).................

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001206389.2 NCBI
ACCUUGCGUCCGCAGUACCGACCCGCACGCUCUUCAGCGCAUCCCUAGU… 877 nt 0.5964
NM_006119.6 NCBI
AGCCAGCGGCCACCGGCUCCGGCAGCGGCGCACAGCGAUUCGGUGCGGC… 1082 nt 0.6340
NM_033163.5 NCBI
AGCCAGCGGCCACCGGCUCCGGCAGCGGCGCACAGCGAUUCGGUGCGGC… 1169 nt 0.6424
NM_033164.4 NCBI
AGCCAGCGGCCACCGGCUCCGGCAGCGGCGCACAGCGAUUCGGUGCGGC… 1114 nt 0.6553
NM_033165.5 NCBI
AGCCAGCGGCCACCGGCUCCGGCAGCGGCGCACAGCGAUUCGGUGCGGC… 1049 nt 0.6416
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the fibroblast growth factor (FGF) family. FGF family members possess broad mitogenic and cell survival activities, and are involved in a variety of biological processes, including embryonic development, cell growth, morphogenesis, tissue repair, tumor growth and invasion. This protein is known to be a factor that supports androgen and anchorage independent growth of mammary tumor cells. Overexpression of this gene has been shown to increase tumor growth and angiogensis. The adult expression of this gene is restricted to testes and ovaries. Temporal and spatial pattern of this gene expression suggests its function as an embryonic epithelial factor. Studies of the mouse and chick homologs revealed roles in midbrain and limb development, organogenesis, embryo gastrulation and left-right axis determination. The alternative splicing of this gene results in four transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A review of the literature indicates that FGF8 shows a high expression level in the late blastema during Xenopus laevis regeneration [Kosykh et al. DOI:10.3390/ijms24097895].