Basic Information

Symbol
FGFBP1
RNA class
mRNA
Alias
Fibroblast Growth Factor Binding Protein 1 HBP17 FGFBP 17 KDa Heparin-Binding Growth Factor-Binding Protein Fibroblast Growth Factor-Binding Protein 1 17 KDa HBGF-Binding Protein FGF-Binding Protein 1 FGF-BP1 FGFBP-1 FGF-BP Heparin-Binding Growth Factor Binding Protein HBp17
Location (GRCh38)
4:15934507-15939171
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005130.5
Sequence length
1351.0 nt
GC content
0.4848

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-412.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -437.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 338.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005130.5 NCBI
GAAUCAUUGCACUCCCUACUAGAGCGGAUGUGAUGAGGGAAAAGGAGAA… 1351 nt 0.4848
Summary

This gene encodes a secreted fibroblast growth factor carrier protein. The encoded protein plays a critical role in cell proliferation, differentiation and migration by binding to fibroblast growth factors and potentiating their biological effects on target cells. The encoded protein may also play a role in tumor growth as an angiogenic switch molecule, and expression of this gene has been associated with several types of cancer including pancreatic and colorectal adenocarcinoma. A pseudogene of this gene is also located on the short arm of chromosome 4. [provided by RefSeq, Nov 2011]

Forensic Context

A study in human skin wound healing demonstrated that the FGFBP1 is expressed in migrating basal keratinocytes (Bas-mig) [Liu et al. DOI:10.1016/j.stem.2024.11.013].