Basic Information

Symbol
FGFR1OP2
RNA class
mRNA
Alias
FGFR1 Oncogene Partner 2 DKFZp564O1863 Fibroblast Growth Factor Receptor 1 Oncogene Partner 2 Wound Inducible Transcript 3.0 HSPC123-Like WIT3.0
Location (GRCh38)
12:26938401-26966650
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015633.3
Sequence length
2932.0 nt
GC content
0.3523

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-718.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -774.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 798.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001171887.2 NCBI
AGUUCUCCGGGAGCGCCGGUCGGAGGCGGUCGGCGGAGGUGUCUACCCC… 2818 nt 0.3485
NM_001171888.2 NCBI
AGUUCUCCGGGAGCGCCGGUCGGAGGCGGUCGGCGGAGGUGUCUACCCC… 888 nt 0.4685
NM_015633.3 NCBI
AGUUCUCCGGGAGCGCCGGUCGGAGGCGGUCGGCGGAGGUGUCUACCCC… 2932 nt 0.3523
Summary

Predicted to enable identical protein binding activity. Predicted to be involved in response to wounding. Predicted to act upstream of or within wound healing. Predicted to be located in cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the FGFR1OP2 as an mRNA marker increasingly expressed with age in a U.S. whole blood RNA-Seq data set [Dørum et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2023.102976].