Basic Information

Symbol
FGGY
RNA class
mRNA
Alias
FGGY Carbohydrate Kinase Domain Containing FGGY Carbohydrate Kinase Domain-Containing Protein D-Ribulokinase FGGY FLJ10986 D-Ribulokinase EC 2.7.1.47 EC 2.7.1
Location (GRCh38)
1:59295910-59810647
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018291.5
Sequence length
1873.0 nt
GC content
0.4944

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-635.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -670.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 622.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001113411.2 NCBI
ACACCCGCCGGGCCGUUGUUCCCGAGACGUUGUUGAGUCCCCUGUGUCC… 1942 nt 0.4954
NM_001244714.2 NCBI
CAAAGACUUCAACCCAUCUGUGACUUGGCAUUGUCUCUGAGGGGGGAAA… 1694 nt 0.4870
NM_001278224.2 NCBI
GCCAGUCUUUCCCAUGCUGUUCUCGUGAUAGUAAGUCUCACAAGAUCUG… 1166 nt 0.4768
NM_001350790.2 NCBI
CAAAGACUUCAACCCAUCUGUGACUUGGCAUUGUCUCUGAGGGGGGAAA… 2030 nt 0.4877
NM_001350791.2 NCBI
CAAAGACUUCAACCCAUCUGUGACUUGGCAUUGUCUCUGAGGGGGGAAA… 1962 nt 0.4867
NM_001350792.2 NCBI
CAAAGACUUCAACCCAUCUGUGACUUGGCAUUGUCUCUGAGGGGGGAAA… 2125 nt 0.4809
NM_001350793.2 NCBI
GCCCCGGGACCGCCCUGCUCAGGCGCCGUGGGGUUCGGCGCGGCUACGU… 2075 nt 0.4887
NM_001350794.2 NCBI
CAAAGACUUCAACCCAUCUGUGACUUGGCAUUGUCUCUGAGGGGGGAAA… 1863 nt 0.4815
NM_001350795.2 NCBI
ACACCCGCCGGGCCGUUGUUCCCGAGACGUUGUUGAGUCCCCUGUGUCC… 1678 nt 0.4970
NM_001350796.2 NCBI
GCCCCGGGACCGCCCUGCUCAGGCGCCGUGGGGUUCGGCGCGGCUACGU… 1693 nt 0.4885
Showing 1 to 10 of 14 entries
Summary

This gene encodes a protein that phosphorylates carbohydrates such as ribulose, ribitol, and L-arabinitol. Genome-wide association studies in some populations have found an association between polymorphisms in this gene and sporadic amyotrophic lateral sclerosis, but studies of other populations have not been able to replicate this association. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.