Basic Information

Symbol
FGGY
RNA class
mRNA
Alias
FGGY Carbohydrate Kinase Domain Containing FGGY Carbohydrate Kinase Domain-Containing Protein D-Ribulokinase FGGY FLJ10986 D-Ribulokinase EC 2.7.1.47 EC 2.7.1
Location (GRCh38)
1:59295910-59810647
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018291.5
Sequence length
1873.0 nt
GC content
0.4944

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-635.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -670.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 622.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((((........)))).((((((...(((((((((...((((...((((((((.((((((((..(((((.....((((((...(((((((((....(((((((((((((((((((.......)))))))))))).((((((((((....((.((((((((((((((((..........)))))))........)))).))))).))...)))))).))))(((((((.((.(((((...(((.....)))))))).))((((......)))).....(((((...........))))))))))))...........))))))))))))))))))))))))))).))))))))..))))..))))......))))))))))))).......)))))).....(((((.(((.(((((((......(((......((((..(((((..(((((.((..((((((((((........))))((((((((((((((....)))))))..........((((((((((.((.((((((....))).))).))((((((((((.(((((......)).)))(((((((..........(((((((.....((((....))))(((((((.((((((((((((((..(((...(((.((((..((((((((((((......))))))...........(((((((.......(((((((..........))))))).....)))))))..(((.((....))))))))))))))).))).))))))))))).)).)))))))))))...))))))).((((((((((.((((...(((.........(((.(((((((((((((((.......(((.(((((.(.(((......)))).)))))))).((((.((.(((((.(((....)))))))).)).)))).........)))))))))...)))))).))))))...)))))))))......))))).))))))).))))))))))))))))))))(((((((..(((((((........((((((...(((((.((((((((..(.(((....((((((.....))))))))))))))))))))).....))...)))))))))))))..)))).)))..................)))))))(((((((.(((((.(((((..(((.((((((((((..(((((......))).))..))..))))..)))))))....)))))..)))))))))))))))))).....)).))))).....)))))..)))).....)))))))))).))).))))).((((((((((((((((...((((....)))).(((((.(((((((......)))))....(((((...((((.(((.....))).)))).((((.....))))))))).....)).))))).............((((((.(.......).))))))))))))))..........)))))))).........)))))))......((((((.(((..((((((((((((.....((((((.....))))))....((........))....(((((((.......)))))))((..(((((((..........((((((((.....((((((((((((....(((((.....))))).))))))))))))((.((((.....)))).))..((((((..(((((.(((.........))).)))))))).))).........))))))))...)))).)))))....))))))))))))(((((.....(((((.(((((.....))))).)))))..)))))...))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((((.((({{,{{.(((((,(((((((((..((({((((.,,(((,.....}}}|||,}|||||||}}}}}}|.}.}}}|}}},...{{{,,,,.}}}.},..}}}})))|((((((((.......)))))))),.,,.((((((((((....((.((((((((((((((((.......,..)))))))........)))}.))))).))...)))))).)))).(((({...})))).{({{({{,{{{{{,{,(({{.{|,|,..{{{{{,,{{{(,,{((({{(({..{{{{,,,.((((({{.{|{{{(({{,..((((((((|||,(((((((..((((.(((...{|...,,...))))))).))))))))}}(((....)))..,,.....,,..)))))))).|||}},,,|||,.,,,.{||..,..,(((((((((({{,|||{{{({{{({{{((((((........}}})))|,}}}},))}}),...(((((((((.{,.....{((((((({..((((({(({.{(..(((((((((((((,,,(((((((.(((.....))).))))},.({||{,.,,..|||||{{.....((((....))))(((((((.((((((((((((((..{((...(((.((((..((((((,(((((......)))))||........,.(((((((.......(((((((.,......,.))))))).....)))))))..(((.((....))))))))))))))).))).))))))))))).)).)))))))))))..{||||||},{{{(((((({.((({,,.(({........{(((.(((((((((((((((.......{{.{(((((.,.(((,.....}))).))))))}}.{(((.((.(((((.(((....)))))))).)).)))),...,,...))))))))),..}))))).))))||,.,||}}}}})),.,,,.|}}||,|||||||||||{{,,,,.,,,{{(({{{,,,{|||{{((((((({........|||||}}}||(((.((((((({..,.,((....((((((.....))))))}))}))))))))))).....}}.,,))))}}}})))))|,))|}.||},....,|,....||,.{{||,}}}}}}}|}}}.,,,||,{((({,{||}}|||||}},.},,}||||,},,,,}}},)},,}||||}...,})}))))..}}}}}})})),,)))))))))..,.}}.}))((((.(((((,,((.((((.......))))..))..}.))))).)))).))))))..,,)))))))||||{.((((((((({{{{{{,,,,(((((......)))))....(((((,.{(((({((({{..{|||,|||,.{(((.....))))|||||,,(((((({|{|{{{{{{{((({...((((((,{......,},))))))..,)},,,,,},))))})))).))},..,,})))})))))})}}}}}}.,.}}}}}))}}})))))){{{||...,.|)))}}}},,.,))))))))))).....,}}}}..,,(((((((.......))))))}.,}}.,,{,,,.........,,{,.,..,.....((((((((((((....(((((.....))))).)))))))))))),{.((((.....)))).}}..,.}}}}}}}}}(((((.{{{((((({....)))).)},,}}))))}.....)))))))}}}))))).))))}}}).}))))))),,.,.}}}}.}}}}|||||}|||,{.}}}}),,,,.,)),}}}}.,))))))),.))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001350797.2 NCBI
GCCCCGGGACCGCCCUGCUCAGGCGCCGUGGGGUUCGGCGCGGCUACGU… 1756 nt 0.4920
NM_001350798.2 NCBI
GCCCCGGGACCGCCCUGCUCAGGCGCCGUGGGGUUCGGCGCGGCUACGU… 1670 nt 0.4838
NM_001350799.2 NCBI
CAAAGACUUCAACCCAUCUGUGACUUGGCAUUGUCUCUGAGGGGGGAAA… 1751 nt 0.4854
NM_018291.5 NCBI
ACACCCGCCGGGCCGUUGUUCCCGAGACGUUGUUGAGUCCCCUGUGUCC… 1873 nt 0.4944
Showing 11 to 14 of 14 entries
Summary

This gene encodes a protein that phosphorylates carbohydrates such as ribulose, ribitol, and L-arabinitol. Genome-wide association studies in some populations have found an association between polymorphisms in this gene and sporadic amyotrophic lateral sclerosis, but studies of other populations have not been able to replicate this association. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.