Basic Information

Symbol
FGL1
RNA class
mRNA
Alias
Fibrinogen Like 1 HPS Hepassocin HFREP-1 Hepatocyte-Derived Fibrinogen-Related Protein 1 Liver Fibrinogen-Related Protein 1 Fibrinogen-Like Protein 1 LFIRE-1 HFREP1 HP-041 Hepatocellular Carcinoma-Related Sequence LFIRE1
Location (GRCh38)
8:17863528-17910378
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004467.4
Sequence length
1237.0 nt
GC content
0.4236

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-360.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -384.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 269.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004467.4 NCBI
AAUGCAGUUACAGGAUCCUGGGAAGCAGAGUGUCUGGAUGGAACCUGAG… 1237 nt 0.4236
NM_147203.2 NCBI
AAUGCUAAUUUAUUUCACAGGUAUGAUAGUAACCAAAACUCAGGUAACA… 1373 nt 0.3955
NM_201552.1 NCBI
AAUUACAAAUUCCCAAUGCAGUUACAGGAUCCUGGGAAGCAGAGUGUCU… 1412 nt 0.4051
NM_201553.1 NCBI
AAUGCUAAUUUAUUUCACAGGUAUGAUAGUAACCAAAACUCAGGUAACA… 1500 nt 0.3913
Summary

Fibrinogen-like 1 is a member of the fibrinogen family. This protein is homologous to the carboxy terminus of the fibrinogen beta- and gamma- subunits which contains the four conserved cysteines of fibrinogens and fibrinogen related proteins. However, this protein lacks the platelet-binding site, cross-linking region and a thrombin-sensitive site which are necessary for fibrin clot formation. This protein may play a role in the development of hepatocellular carcinomas. Four alternatively spliced transcript variants encoding the same protein exist for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that ionizing radiation (6 or 12 Gy X-ray) induced gastric injury, characterized by mucosal atrophy and abnormal cell morphology, and was accompanied by a significant increase in serum pepsinogen A and pepsinogen C levels [Chen et al. DOI:10.1177/1559325819886766].