Basic Information

Symbol
FHL1
RNA class
mRNA
Alias
Four And A Half LIM Domains 1 SLIM1 FHL1B XMPMA FLH1A Four And A Half LIM Domains Protein 1 Skeletal Muscle LIM-Protein 1 LIM Protein SLIMMER BA535K18.1 MGC111107 SLIM-1 KYO-T FHL-1 SLIM Four-And-A-Half Lin11, Isl-1 And Mec-3 Domains 1 Four-And-A-Half LIM Domains 1 SLIMMER RBMX1A RBMX1B FCMSU FHL1A KYOT
Location (GRCh38)
X:136146702-136211359
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001159699.2
Sequence length
2286.0 nt
GC content
0.4589

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-701.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -744.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 506.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001159699.2 NCBI
AGCCUUAUCAGCUGGGGUUGAGGGAAGACUGGUCUAGGUGCUGCUCCUG… 2286 nt 0.4589
NM_001159700.2 NCBI
GUCUGUUCUAGGCUCUGGGACAGAGGUUUCUGCUUUCGAAGUUUCUCUU… 2451 nt 0.4561
NM_001159701.2 NCBI
AUUCCGGUACAGGGAUGACUUUCUAUGUGGCCUCUCUGGCUCUGGAGCU… 2273 nt 0.4580
NM_001159702.3 NCBI
AGUCCGCAGCCGCCGCCGCCACCGCCGCGCCUCGGCCUCGGUGCAGGCA… 2568 nt 0.4794
NM_001159703.2 NCBI
AGUCCGCAGCCGCCGCCGCCACCGCCGCGCCUCGGCCUCGGUGCAGGCA… 2181 nt 0.4663
NM_001159704.1 NCBI
ACACCUGUUUCCUAGUGCUGCAGAACCCUCGUCCUGGGAUGAGCCUGCC… 2906 nt 0.4443
NM_001167819.1 NCBI
UAACAAUGCUGAGUGUUUGAGCUAAUACGGCUUGAUAAUGAGGGAGCCA… 2392 nt 0.4519
NM_001330659.2 NCBI
AGCCUUAUCAGCUGGGGUUGAGGGAAGACUGGUCUAGGUGCUGCUCCUG… 2099 nt 0.4531
NM_001369326.1 NCBI
GUGCGCGCGUGUGUGCCUCCCGCCCGCCGGCGUCCUGGGUCCCGGGGGA… 2699 nt 0.4946
NM_001369327.2 NCBI
ACCUCUUGGUUCUUUCAGCCAGGAUAGCUAGCAGGGGCUGUGGGGAGCG… 2536 nt 0.4696
Showing 1 to 10 of 15 entries
Summary

This gene encodes a member of the four-and-a-half-LIM-only protein family. Family members contain two highly conserved, tandemly arranged, zinc finger domains with four highly conserved cysteines binding a zinc atom in each zinc finger. Expression of these family members occurs in a cell- and tissue-specific mode and these proteins are involved in many cellular processes. Mutations in this gene have been found in patients with Emery-Dreifuss muscular dystrophy. Multiple alternately spliced transcript variants which encode different protein isoforms have been described.[provided by RefSeq, Nov 2009]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the FHL1 is a marker for stress-responsive cardiomyocytes, being expressed in the stress-responsive ventricular cardiomyocyte cluster vCM3 [Bian et al. DOI:10.3892/mmr.2025.13680]. In rhesus macaques, the FHL1 was identified as a shared upregulated differentially expressed gene between affected animals and pediatric human patients with hypertrophic cardiomyopathy [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].