Basic Information

Symbol
FHOD3
RNA class
mRNA
Alias
Formin Homology 2 Domain Containing 3 FHOS2 KIAA1695 Formin Homolog Overexpressed In Spleen 2 FH1/FH2 Domain-Containing Protein 3 Formactin-2 FLJ22297 FLJ22717 Formactin2 HFHOS2 CMH28
Location (GRCh38)
18:36297676-36780220
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001281740.3
Sequence length
5682.0 nt
GC content
0.5377

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2009.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2114.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1451.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((..(((((((((((((.((((((((((((((((.......)).)))))))(((((((((((((.(((((((((((((.......))))).))))).......))).))))))).....(((((...)))))..)))))))))))))))))....((.((((((((.(((((((.(((((((.((((.((.(.(((((((.(((..(((((.((..(((.((((((((.(((.((((.....))))))))))))))...(((((((((((.((((((....)).)).)).)))))....)))))).........).)))...)).))))).))).)))).....))).).))..))))..)))))))...((.((((((((((.((.(.((..........)).).)).)))))))..))).)).))))).)).)))))))).))......................)))..))))))..)....(((((((....)))))))(((((((......)))))))......((((...(((((.......((((((..((((.(((((((((.((((..((.......))....)))))).)))).))).)))).))))))......(((((((((((((.((........)).)))((((..(.(.((..((.....))..)).).)..))))((((.((((((....(((((((((((.........))))))))).))..)))))))))).(((.((((........))))))).))))))))))...)))))..))))....)))))).(((((.(((((((((.....((((((((....(((((........((((((((.((..((((((.....(((.(((((((((((.(.....(((...(((((((((((((.....))))..)))))..(((((..(((.(((.(((..(......)..))).))).)))(((((((....(((((.(((..((((((((.....)))))............(((((((((.(((........(((((.((((.......))))..((((((((.....(.((.((((..((......))..))))))).....))))))))(((((.((.((.(((((.(((.((((((........((.((..((((((((((((((.((......))...).))))).))))))))...)).))..))))))..))).))))))).)).)))))))))))))))))).)))))))..)))))))).((((((.(((....((((((....(((((.(((.((((....((.((((((..(((((((((...))))))((((.((((((.(((((((((((((((.(((((.((((((.....((((((((.(((((((.(((((((((((....))..((((......))))....)))))))))(((((((.(.((........)))..)))))))..(((((((((((((......(((((.(((((.....((((..(((((.((((.......))))....))))).)))).....))).)).)))))(((((((.((((...((((((.(((......)))...(((..(((.......))).)))...(((((((..((.((..(((..............(((((((((.((.(((((....(((((((.((((...(((((((((((((.((((((((.....))).........))))).)))))))))))))........(((((.(((((((((((.((((((..(((((((((((......)))..((((....(((((..............(((((.............(((((...(((((...........))))).)))))............))))))))))))))))))))))......))))))(((((((...((.((((.(..((.((..(.....((.(((....))).))....)..)).)).).))))))))))))))))))).)))))..)))))(((...(((.........)))..)))..........))))...).))))))))))).))))...)))))))..............)))..)))).)))))))))))))..)))...).))))))).)))))))).))).)).))))))).)))))))).))))))..)))))(((.((((((..(..(((((((((((((((....)))))...((((((...((((...(((....)))(((.((.((((.((((((((.((..(((((.((((.(((.............)))..)))).))))).....))....))))))))))))))))).)))).)))))).)))))))))).....)..)))))).))).(((((((..((((((.(((((((((((((((((..(((((..(((.((......)).)))..........(((((.((.........)).))))).....((.(((((((..(.(((((...((((((((((...(((((((.....(((((((.....)))))))..(((((((.(((((..(((.....((((((((((((.....((..(((.((((((...((((((...(((....)))..))))))))).))).))).))..(((.......)))(((....))).(((((((....(((..(((((...(((((.........)))))((((((.(((((..((((((....)))))).((.((((.((((........)))))))).))..((((((((((((.(.(((..(((((((..(...)..)))))))))).).)))))))))))).((((((.(((...((((.(.(((((....)))))).))))....)))))))))((((...(((((.((((((((.((((((((....((((((..........(((((((((........((((...)))).((((...)))).......)))))))))..(((.(((.....))).))).))))))((((((.....))))))..........)))))))).)))..........((((.......))))...((((.(((((....))))))))))))))))))).))))(((((......))))).......))))))))))).....))))))))))))))).........)))))))))))).......))).))))).)))))))(((((...)))))...((((((...((((((((...((...)).(((.....)))...(((.....)))......))))))))....))))))((((...))))((((........)))).(((....)))...)))))))..(((..((((((.(((.....(((...((((((..(((((....(((((((((.((((....)))).)))))........))))((((((((..((........))..))))))))............((((((((((((.((((((..((((.(((.((((.(((.........))).)))).)))..))))...((.((((....)))))).........((((.((((.....))))..))))...)))))).)))........))))))))).))))))))).)).....)))...))))))))).))).((((.(((...............))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))).....))))))))).......))))))))))........)).)))))............))))))))..........((((........)))).((......))((((.(((...........))).))))))))))).))).))))))).(((....((((((((((....(((((((((((....)))))..))))......))...))))))))))((((((....(((....(((....))))))))))))((((((((.......))))))))..((.(((((.((((((.((((((((((........))))))))))..(((..((((((((....)))))))))))((((((((.......(((.((((((.(((.((.....(((((.((((...((.....))...))))..))))).....((((((.......(((((......((((...((((.....))))....))))..)))))........))))))..((((((((......))))))))..((..((((.((((((.((.((((((.((((((.......(((((...((((.....))))))))).....((((((..(((..((((((......))))))...)))(((.((((........)))).))).)))))).........)))).....)).)))))).)).)))....)))))))..)).)).)))...)))))).)))....)))))))))))))).))))).)).))).(((((((.(((((((((((((((((....)).))).))).)).)).)).))).)........)))))).))).)))))).)).....)))).))).)))))(((..(((((((............)))))))...)))((((.(((((((((((.((......(((((((((.....))))))))).((((.........))))..((((((((.(.(.(((....))).).).))))))))......((((.((((..((((((...((...((((((((((((...(.(((.(((.((((.....))))..)))))).)......))))......))))(((....))).....))))..)).)))))))))).)))).....(((((.((..((((((...)))))))).)))))(((((((.((((........)))).))))))).((((.(.....).))))(((((.((((((((...((((..(((...(((..............)))))).)))))))))))).))))))).)))))))).))).)))))))))))))))))))..))))))))))))..))))...))).....).))))))))))).))))))))).))))))))))..(((((.......(((((....)).))).......))))))))))....))))))))..(((((.(((((....((((.(((((((....))))).)).))))...))))).)))))....((((((..(((((((((...(((((..(.(.(((...........................)))).)..)))))...)))))))))......(((((.....(((....)))..)))))(((((.....)))))..................(((((((..((((((..(((((............(((((((((.(.........).))))).))))......)).)))..))))))))))))).)))))).(((....((((......)))))))(((((((...........)))))))....))))))))))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(({(((((,{(((({({((((({(((((((({({((((,....,||)||))))))}.{({(((((((((.(((((((((((((.......)))))))}))).....,,))).)))))))..,..||{,.,||}))))}|}|}|||||}|||},|{|.,,.{,,{{{{{{,,.{{{((((.{{{{{{{,{{((.{{{{|{|,|||||{{{,,{{{{.,{,..||||,({{{||{,||{.||||..,,.))))))))))))}}...}||}}}}))|||||||||....)),||,,{,|||{||||.))))|}||,{,{{,,,|||||||,...{{{{{{||{|((({{{{{,||{|{}|{{||||{{||||||}...(({(({,({{{{,.((,..{{...,,..,,,)).),)).)))))))..}},.,}.)))))}))},)))))}|.}|,{{,|,,,,,............{{{..,,}||||||,,..(((((({....}))))))(((((({......}))))))..{{{.,{{({(((({(((......||}}((((((((.,,,,((((((((((((...((.((((((((({(((((.((...((((((((.{{,{{({..,..,((((...}})),.,,.},)},}},.(((((,,({.{.((((((((......((((,,(({...},))}})))).}....)))).)))).}.)).....)))))))))))))...)))))))((({,((.(((((((((...(((.((((.(((.((((((,..((.((.(((({..,((((((.(((((.,{.{{{{.,,,,...(((((((({....{((((((.....{{.,((...,||.,|,.........{({((((({{{{{.,{{,.{,,(({{{{.{{{.,.,,}}}})}}}).,}.,}}}}))},})}}.)))))))))))).)))))).})}}))}))}))).)))))))))))..))}|.,(({{.(((,,.,.))).)))}{{,.........{((,.....))))))))...,.)))..)))).)))...))))),})))))))))....{.((.((((..((......))..)))),)).....|(((.((.(((((.((.((.(((((.(((.((((((...{,{{....||..(((((((((((((,.((......))...,.))))).))))))))...,).}}..))))))..})).))))))).)).))))).)).)))).)))))))))).))))))))........,{{(.,{..(((((({....(((((.(((.((((....((.((((((..,{,((((((...))))))(((,{((((((.((((((({(((((((((((((.((((((..,..((((((((.(((((((,(((((((((.(...,||.,({{,.....,)})),.}.)))))))))|((((((.(.({.,......)),..))))))}..(((((((((((((......(((((.(((((.....((((..{{((({((((.......))))..}}))},}.)))).....))).)).)))))(((((((.((((,..((((((.(((......)))..|||,..||({{,....,,,...},,.(((((((..((.((..(((..,...........(((((((.,.((.(((((....((((((,,((((...(((((((((((({.((((((((.....))).........))))).})))))))))))).{,,.....{{(||((((({(((((.(({((({,({(((((((((.,....}}}....,{,,,,{{{((,,,...,,{|.,,.(((((...{,,,,,,.,,{((((...(((((...........))))).))))},,,.........}})}))}}}))}}))}}}}}}}....,,))))))|||{{{{...{{.{{({.,.,{{.({..{.....{{.{||....))).)),,,.),})},)}.}.)))))}))))))}}}}))),)))))||,}},.||||,,|,..........}))..}}}....,.,,..)))}...).))))))))))).)),,...))))))).............,)))..)))).)))))))))))))..))},..}.))))))).)))))))).))).)).))))))).)))))))),))))))..)))))){{.((((((..(..(((((((((((((((....)))))...((((((...((((...(((....)))(((.((.((((.((((((((.,,..(((((.((((.(((...,.....,...)))..)))).))))).....,.....))))))))))))))))).)))).)))))).})))))))))..,..,..)))))).|||.,,,,,||,.((((((.((((((((((((((((,.{(((((..(((.((......)).)))..........(((((.((.........)).))))).....((.(((((((..(.(((((,..{((((((((({{,(((((((,,.,.(((((((.....))))))).,(((((((.((((({,(((.....((((((((((((.....((..(((.((({(((,.((((((...(((....))}..)))))).))}))).))).||,,{||.......}}}{{{,.,.,||,|{{|||{....{{,..{|||{...{((((.........))))}((((((.{((((..((((({....)|||||,((.(((,(((({{{,,,|..}}}}}))),))..((((((((((((.(.(((..(((((((..(...)..)))))))))).).)))))))))))).(((((({(((...((,|{({(((((....)))}}}})),,,,..))))))))|((((...{((((,(({{{{{{.|||||||,|...{(((((....,,....(((((((((........((((...)))).((((...)))).......)))))))))..{||,|((,.,.,||}.|||,|}||||((((((.....))))))...,,,,..|||||||||,||,..,,,,,...{{{{..,,,,,})}),,.((((.(((((....))))))))),))))))))).)))}{{{{,.,,,,,))))),.}}}.,)))))))}))),.}}})))))))),))))}),}},,,,,,)))))))))))).......))).,))))})))))))(((((...)))))...((((((...((((((((...((...}}.(((,....)))...{((.....}},......))))))))....))))))|{{{...,}}}((((........)))).{({....})}...)))))))..|{{..((((((.(((.....(((...((({((..(((((....(((((,,(({,((({...,|||{||,|,........,}}.,|,{{{|,}}||}}......))}},))),)))},..........((((((((((((.((((((..((((.(((.((((.(((.........))).)))).)))..))))...((.((((....))))))....,,..,{(({.{({{.....)))}..}}}},..)))))).)))........))))))))),)))))}})).)).....)))...))))))))).}}}.({{(,{{{.....,........,))),)}}}))))))))))))))))))))))).)))))))))}}..,,.))))))))).......)))))))))),,,,....}}.}},}}............)))))))).,,,..{{,.,,{|},..||,.}}},,||......}}{(((,{{{..,,,......})),)))}))))))).))).))))))).{{{....((((((((((....(((((((((((....)))))..))))......))...)))))))))),{{{((,...|||....(((....))}})}}}||||((((((((.,....})))))))).}||,,{{({.((((((.((((((((((........))))))))))..{({..((((((((....))))))))))}{(((((((.......(((.,(((((,(((.{,.....(((((.((({..,((,....})}},})))..))))}.....{{{{{{.....,.|||||......{(({.,.((((.....))))....))))|,,,,})........,,,,,,..((((((((......))))))))..((..((((.(((((({((.((((((.((((((...,...{{{{{...{{{{.....}}}}}}}},.....((((((..(((..((((((......)))))},..)))(((.((((........)))).))).)))))).........)))}..,}}.)}))))}),},.}))....)))))))..)).}).)),,,.)))))),)}}....)))))))})))))).})|||,||.|}}.((((,{{,(((({{{{{{(((((((....)).})).))}.}),)).)).)))}),,),)).,)))))).}),.)))))).)).....)))).))).))))){{{,.(((((((........,...))))))).),))))))).|..))}.{,{{{{,.,,,,.{((((((((.....))))))))).}},))))}...}})))}..((((((((.(,(.(((....))).).).))))))))...))))))))}))))).)),,}}}{(((((.(((((,(((((((((((...{{{.((((.....))))..,}}(((((.,......(((((((((((((((..(((((((((((((((.,,,}},))))}{{{((((((...((((,.({{,((((((...}}}}}}|,.||||}.,,|||||{((,.((((({(.(((((({,.,{,((((.(.....,,))))|((((.(((((((({.{((,,..(((,.,{.,....,,.}),,...}},))}.))..}))))))).))))).},.))))))).)}..))))).,))}}.{{{{{((....))}}}}}}}..})))},,...,..))))...)))))))))..((((((({{((,.(((.{....})))...,,,,,.,,,.((.(((((((((((....((((........))))....)))).............))))))).))(((((((((...{(((((.,......}.)))))|,,..(((((..(((((((((...,,,,{......{((,.,.......,{{,,........,...}}},.}..))))).,.))))))))).))))),|||{.....(((....,,,..,}}}}(((((.....)))))...,,,,.{{{......}}}.}}}}..)))))))))))))))).....,)))))))))....(((.{{.....}).))).))))).)),,)))))))..}.)))))..))))))).....))))....))))))))))),}}.,,|||||}}}}}}})..,))))})),}}}))},...,))))}})},...,,..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001281739.3 NCBI
GAGCCUGCGAGUCCGCGAGCCAGCGAGCUGCGGCUGCGGCCUCCCCUGC… 5082 nt 0.5335
NM_001281740.3 NCBI
GAGCCUGCGAGUCCGCGAGCCAGCGAGCUGCGGCUGCGGCCUCCCCUGC… 5682 nt 0.5377
NM_025135.5 NCBI
GAGCCUGCGAGUCCGCGAGCCAGCGAGCUGCGGCUGCGGCCUCCCCUGC… 5133 nt 0.5322
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the diaphanous-related formins (DRF), and contains multiple domains, including GBD (GTPase-binding domain), DID (diaphanous inhibitory domain), FH1 (formin homology 1), FH2 (formin homology 2), and DAD (diaphanous auto-regulatory domain) domains. This protein is thought to play a role in actin filament polymerization in cardiomyocytes. Mutations in this gene have been associated with dilated cardiomyopathy (DCM), characterized by dilation of the ventricular chamber, leading to impairment of systolic pump function and subsequent heart failure. Increased levels of the protein encoded by this gene have been observed in individuals with hypertrophic cardiomyopathy (HCM). Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. A muscle-specific isoform has been shown to possess a casein kinase 2 (CK2) phosphorylation site at the C-terminal end of the FH2 domain. Phosphorylation of this site alters its interaction with sequestosome 1 (SQSTM1), and targets this isoform to myofibrils, while other isoforms form cytoplasmic aggregates. [provided by RefSeq, Aug 2015]

Forensic Context

A study in humans using subcutaneous adipose tissue from BMI-discordant monozygotic twin pairs identified the FHOD3 as a gene downregulated in the heavier co-twins [Muniandy et al. DOI:10.1038/ijo.2017.95].