Basic Information

Symbol
ABCB6
RNA class
mRNA
Alias
ATP Binding Cassette Subfamily B Member 6 (LAN Blood Group) MTABC3 Umat ATP Binding Cassette Subfamily B Member 6 (Langereis Blood Group) Ubiquitously-Expressed Mammalian ABC Half Transporter ATP-Binding Cassette Sub-Family B Member 6 ATP-Binding Cassette Half-Transporter ABC-Type Heme Transporter ABCB6 Mitochondrial ABC Transporter 3 P-Glycoprotein-Related Protein Mt-ABC Transporter 3 EST45597 PRP ATP-Binding Cassette, Sub-Family B (MDR/TAP), Member 6 (Langereis Blood Group) ATP-Binding Cassette, Sub-Family B (MDR/TAP), Member 6 EC 7.6.2.5 EC 3.6.3 UMAT ABC LAN
Location (GRCh38)
2:219209766-219219012
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005689.4
Sequence length
2980.0 nt
GC content
0.5906

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1262.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1317.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 790.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001349828.2 NCBI
AUUCCCGUGGGCCUGCAGUUGGCAGGAGGGUCCCGGGCCCAGAGCCAGC… 2842 nt 0.5922
NM_005689.4 NCBI
AUUCCCGUGGGCCUGCAGUUGGCAGGAGGGUCCCGGGCCCAGAGCCAGC… 2980 nt 0.5906
Summary

This gene encodes a member of the ATP-binding cassette (ABC) transporter superfamily. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. This protein is a member of the heavy metal importer subfamily and plays a role in porphyrin transport. This gene is the molecular basis of the Langereis (Lan) blood group antigen and mutations in this gene underlie familial pseudohyperkalemia and dyschromatosis universalis hereditaria. [provided by RefSeq, Mar 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.