Basic Information

Symbol
FIZ1
RNA class
mRNA
Alias
FLT3 Interacting Zinc Finger 1 ZNF798 Flt3-Interacting Zinc Finger Protein 1 Zinc Finger Protein 798 FLJ14768
Location (GRCh38)
19:55591371-55606194
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032836.3
Sequence length
2645.0 nt
GC content
0.6631

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1232.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1272.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 673.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_032836.3 NCBI
GACGCUGCCCCCGCUGCCCAAAAUGUCGGCGCCCAGAGGGAGGUAGAGA… 2645 nt 0.6631
Summary

This gene encodes zinc finger protein, which interacts with a receptor tyrosine kinase involved in the regulation of hematopoietic and lymphoid cells. This gene product also interacts with a transcription factor that regulates the expression of rod-specific genes in retina. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human postmortem dorsolateral prefrontal cortex demonstrated that the FIZ1 exhibits a complex expression pattern in major depressive disorder and suicide [Pantazatos et al. DOI:10.1038/mp.2016.130].