Basic Information

Symbol
FKBP10
RNA class
mRNA
Alias
FKBP Prolyl Isomerase 10 FKBP65 HFKBP65 Peptidyl-Prolyl Cis-Trans Isomerase FKBP10 FK506 Binding Protein 10, 65 KDa 65 KDa FK506-Binding Protein FK506-Binding Protein 10 Immunophilin FKBP65 PPIase FKBP10 65 KDa FKBP EC 5.2.1.8 FLJ22041 FLJ20683 FLJ23833 Rotamase FKBP-10 FKBP-65 FKBP6 Osteognesis Imperfecta With Congenital Joint Contractures Telopeptide Lysyl Hydroxylase, Bone-Specific FK506 Binding Protein 10 (65 KDa) FK506 Binding Protein 10 PPIASE BRKS1 BRKS OI11 TLH1 OI6
Location (GRCh38)
17:41812680-41823221
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_021939.4
Sequence length
2585.0 nt
GC content
0.5926

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1072.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1112.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 605.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((..(((((((..(((...((((((.(.((((((((...((((((((...(((....(((((((((((((((((.(..((((...))))..).)).)).)..))))).)))))))(((((((......)))))))))).))))))))(((((..((((((((.(((....))))))))))).))))).((((....)))).(((.(((.((((((.....(((.(((((((........((......((..(((((..(((......)))..)))))..)))).......)))))))))).(((((((((((...))))).)))))).(((((((...(((((.((....((.(((......))).))...)).))))).))))))))))))).))).)))..)))))))).))))))).(((...(((((....)))))...)))............)))..)))))))..)))((((((((((((((((((.....))))((((...))))..((((.(((((((((((..(((.((((..(((.((((((..(((((....((((((((..((((((((((((((((((...(((((((...(((((....(((((.......)))))(((......)))(.((((((((.(((.......)))...)))))))).).)))))(((((((((..((((.((...(((((((..........(((....)))((((((((.......)))))))).((((((..((......))..)))))))))))))...)))))).)))..))))))......))))))).))))))))))...((.((((((((.((((((((((((.((....)).)))))))...)))))))))).))))).(((......))).(((.....)))((((.((((..((.(((((.......((((........................))))..(((.........))).))))).))..)))))))).))))))))(((..((((((.....((.......)).)))))).))).(((.((...)).))).(((((..((((((..((..(...(((...))))..))..))))))...)))))(((...))).(((.((....)).)))))))))))......)))))..)))...))).)))..)))))))...(((.((.(((....))))).)))...((((((((.......((((....(((((((((((.....))))))))....))).....))))((((((...((((....)))).)))))).....))).)))))(((((((....)))))))...))))).))).(((((..((..((((..((.......))..))))..))..)))))(((((((.(((((((.(((....))).)))...(((((((((((((((...((((..(((((.....((.((((.(((((((((((((((.....))))))).)))....)).))))))).))....((((....)))).(((((((..((....))..))))))).....((((.(((((...(((((......((((....)))))))))...))))).))))....(((((((...(((((.(.....).)))).)...)).))))).)))))..)))).....))))))).))..)))))).((((((((((.((((..(((((.(((....((((((.((.(((....))).))))((((((..(((.(((.((((((((((((((((((((((....(((.(((((((...(((((((((((.....))))))....))))).)))))))(((((((((...(((.(((.((((..........))))...((((....))))((((....))))..))).)))....)))).)))))))).)))))...)))))))...((((.(((((..((((..(((((((.((((((......))))..)).)))))))...))))....))))).))))..))))).)))))))).)))..))...)))).))))....)))))))).)))))))))))))).)))))))))))................((.((.....))))..(((((((((((((((...(((.....((..((...((((((.(((((((.((((((((((((...((.....))......)))..))))))))).......(((((((....((((.(.(((((((((((...((.(((((((((((((((...((((.((......)).)))))))))))))..((..((((((....)))))).))............((.(((((.....))))).))......))).))).))...))))))))))).).))))...)))))))))).)))).))))))...))..))...)))...))))))).)))))))).))).)))).(((..(((.(((((...((......))))))))))..))))))))).))))))))..................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{{{..(((({(({{((....((((((.(.((((((((.,,((((({{(,{,(((.,..(((((((((((((((((.(..((((...))))..}.)).)).}..))))).)))))))(((((((,.....))}))))}}|{||||||,|(((((..((((((((.(((....))))))))))).)))))},,,|}}}}))),.(((.(((.((((({.....(((,,,,.,,,,......{||||...{((..(((((..(((......)))..)))))..))}.....{{{{|||,||||,.(((((((((((...))))).)))))),|||,{,,,}}||||(,{,..}|((.{({,,,,,.}}}.}}{,,}},)))}).,,)))))}))))).))).)))..)))))))).))))))).|||}},{{{(({,.,|||,|{{{|,,{{......)}.))))},)))}))),.)}}((((((((((((({((((,,,,.||}|{(({...,|||.,((((.(((((((((((..(((.(((({{((.{((,(((..(((((....((((((((..((((((((((((((((((...(((((((..,{((((,...{{,{({{,,,,.,,,,}{,{.,,,..))}||||{|{,{{|{||{{{{{{(((({{({{(((({{,{{.}|||{,.|}}|||||((((.(,({.(((.{,...}).)))}))).,}}|((,((((((((.......)))))))).))}})}},..))}},,)))),,,)))))},..{{{|||},...,,,.))))}),...,,.))))))).))))))))))...((.((((((((.((((((((((((.((....)).))))))))..))))}))))).))))).(({......})).(((.....)))((((.((((..((.(((((.{{....,,,|........................,)))..{||},.......,}}.))))).))..)))))))).)))))))).((((((.(((..(((((.......{({({|((({{{.....}|....)))).).|)))...,(({.....,.))})))))))).))))))......,,...|||}|,|||..,))}.(((.((....)).)))))))))))......)))))..)))}}},}}.}))}.)))))))...(((.((.(((....))))).)))..,((((((((.......((((....(((((((((((.....))))))))....))).,}..))))((((((...((((....)))).)))))).....))),}))))(((((((....)))))))...))))).))).(((((..((..((((..((.......))..))))..))..)))))(((((({,(((((((.(((....))).)))...(((((({((((((((,..((((..(((((.....((.((((.(((((((((((((((.....))))))).)))}...|}.))))))).))..,,({{{,,..|},,.(((((((..({....))..))))))).....((((.(((((...((((({{....{{,,...,}})))))))...))))).))))....(((((((,,.{((((.(.....).)))).}.,.))}})))).)))))..))))..,..)))))))}.}..)))))).(((((((((,,((((..(((((.((({,,.({(({(.((,(((....))).))},{{((((..(((.(((.((((((((((((((((((((((....,,{.(((((((...(((((((((((.....}}}))).,}.))))).)))))))(((((((((...(((.(((.((((..........)))),{{((,,...,)))|((((....))))..))).)))....)))).))))),}).)))))...)))))))...((((.(((((..((((..(((((((.{(((((......)))).,)).)))))))...))))....))))).))))..))))).)))))))),)))..))...)))),)))),.,.)))))))).)))))))))))))).)))))))))))................,{.{(.....)}},..(((((((((((((((...(((......{..{(,..((((((.(((((((.((((((((((((...((.....}}......)))..))))))))).......|((((((....((((.(.(((((((((((...((,(((((((((((((((,..{(((.((......)).))))))))))))).,|,..||{{{{..,.)))))}.||.........,..((.(((((.....))))).))......))).))).)}...))))))))))).).))))...)))))),))).)))).)))))),..)}..,,...)))...))))))).)))))))).))).)))),{||,.|||,{|,||...{{,.....}}))))))}}..}}}}}))))}}}))))))..................

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_021939.4 NCBI
CUCACUGCCGGCGGUCCCAACUCCAGGCACCAUGUUCCCCGCGGGCCCC… 2585 nt 0.5926
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the FKBP-type peptidyl-prolyl cis/trans isomerase (PPIase) family. This protein localizes to the endoplasmic reticulum and acts as a molecular chaperone. Alternatively spliced variants encoding different isoforms have been reported, but their biological validity has not been determined.[provided by RefSeq, Nov 2009]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that exposure to γ-rays induced a down-regulation of the FKBP10 in liver tissue, as identified through oligonucleotide microarray analysis and validated by real-time PCR [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078]. A study in Wistar-albino rats demonstrated that the FKBP10 gene was down-regulated at 12 and 48 hours following mild traumatic brain injury, as identified through whole genome microarray analysis [Colak et al. DOI:10.1016/j.injury.2012.01.021].