Basic Information

Symbol
FKBP5
RNA class
mRNA
Alias
FKBP Prolyl Isomerase 5 FKBP51 FKBP54 P54 PPIase Ptg-10 54 KDa Progesterone Receptor-Associated Immunophilin Peptidyl-Prolyl Cis-Trans Isomerase FKBP5 51 KDa FK506-Binding Protein Androgen-Regulated Protein 6 HSP90-Binding Immunophilin FK506-Binding Protein 5 FK506 Binding Protein 5 PPIase FKBP5 51 KDa FKBP FF1 Antigen EC 5.2.1.8 Rotamase FKBP-51 AIG6 Peptidylprolyl Cis-Trans Isomerase T-Cell FK506-Binding Protein FKBP-5
Location (GRCh38)
6:35572945-35728622
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004117.4
Sequence length
3750.0 nt
GC content
0.4317

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1060.88 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1132.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1059.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145775.3 NCBI
AGAACAAACUCCUACCUCUGUUUGCAACUAAGAGUUACAUCCCCCAUGC… 3935 nt 0.4353
NM_001145776.2 NCBI
AGUCUCGGGCGGCGGUGUCCGGCGCGCGGGCGGCCUGCUGGGCGGGCUG… 3822 nt 0.4385
NM_001145777.2 NCBI
AGUCUCGGGCGGCGGUGUCCGGCGCGCGGGCGGCCUGCUGGGCGGGCUG… 7357 nt 0.4140
NM_004117.4 NCBI
AGUCUCGGGCGGCGGUGUCCGGCGCGCGGGCGGCCUGCUGGGCGGGCUG… 3750 nt 0.4317
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the immunophilin protein family, which play a role in immunoregulation and basic cellular processes involving protein folding and trafficking. This encoded protein is a cis-trans prolyl isomerase that binds to the immunosuppressants FK506 and rapamycin. It is thought to mediate calcineurin inhibition. It also interacts functionally with mature hetero-oligomeric progesterone receptor complexes along with the 90 kDa heat shock protein and P23 protein. This gene has been found to have multiple polyadenylation sites. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Mar 2009]

Forensic Context

A study in humans identified a haplotype within the FKBP5 gene, present in 47% of a live subject cohort, that was associated with an increased risk of suicide attempt (OR=1.58) [Yin et al. DOI:10.1002/da.22499].