Basic Information
Symbol
FKBP6
RNA class
mRNA
Alias
FKBP Prolyl Isomerase Family Member 6 (Inactive)
FKBP36
Immunophilin FKBP36
Inactive Peptidyl-Prolyl Cis-Trans Isomerase FKBP6
FK506 Binding Protein 6, 36kDa
FK506-Binding Protein 6
Inactive PPIase FKBP6
36 KDa FKBP
Rotamase
PPIase
Peptidyl-Prolyl Cis-Trans Isomerase FKBP6
Peptidylprolyl Cis-Trans Isomerase
FK506 Binding Protein 6 (36kD)
FK506-Binding Protein 6 (36kD)
36 KDa FK506-Binding Protein
FKBP Prolyl Isomerase 6
PPIase FKBP6
FKBP-36
SPGF77
FKBP-6
Location (GRCh38)
7:73328161-73358637
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
MANE select
Transcript ID
NM_003602.5
Sequence length
1699.0 nt
GC content
0.5374
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-617.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-647.09 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
528.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AUCAUGUUUCGUGCGCUCCCAUUACGGAUCAUACCUCGCACCUCACCGC… | 1528 nt | 0.5203 | |
| AUCAUGUUUCGUGCGCUCCCAUUACGGAUCAUACCUCGCACCUCACCGC… | 1609 nt | 0.5432 | |
| AUCAUGUUUCGUGCGCUCCCAUUACGGAUCAUACCUCGCACCUCACCGC… | 1408 nt | 0.5249 | |
| AUCAUGUUUCGUGCGCUCCCAUUACGGAUCAUACCUCGCACCUCACCGC… | 1699 nt | 0.5374 |
Summary
The protein encoded by this gene is a cis-trans peptidyl-prolyl isomerase that may function in immunoregulation and basic cellular processes involving protein folding and trafficking. This gene is located in a chromosomal region that is deleted in Williams-Beuren syndrome. Defects in this gene may cause male infertility. There are multiple pseudogenes for this gene located nearby on chromosome 7. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013]
Forensic Context
A study in Wistar-albino rats demonstrated that the FKBP6 gene was down-regulated at 12 and 48 hours following mild traumatic brain injury, as identified through whole genome microarray analysis [Colak et al. DOI:10.1016/j.injury.2012.01.021].