Basic Information

Symbol
FLNA
RNA class
mRNA
Alias
Filamin A ABP-280 FLN1 FLN Endothelial Actin-Binding Protein Actin Binding Protein 280 Non-Muscle Filamin Filamin A, Alpha Alpha-Filamin Filamin-A Filamin-1 FLN-A OPD1 OPD2 Filamin A, Alpha (Actin Binding Protein 280) Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Actin-Binding Protein 280 Alpha Filamin EC 2.1.1.43 EC 6.3.4.4 ABPX CSBS CVD1 FGS2 NHBP XLVD XMVD FMD MNS OPD
Location (GRCh38)
X:154348524-154374638
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001110556.2
Sequence length
8507.0 nt
GC content
0.6228

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3712.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3859.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2091.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001110556.2 NCBI
GCGUGGAGGCGCGUCGCGCGCAGCGGACGCCGACAGAAUCCCCGAGGCG… 8507 nt 0.6228
NM_001456.4 NCBI
GCGUGGAGGCGCGUCGCGCGCAGCGGACGCCGACAGAAUCCCCGAGGCG… 8483 nt 0.6229
Summary

The protein encoded by this gene is an actin-binding protein that crosslinks actin filaments and links actin filaments to membrane glycoproteins. The encoded protein is involved in remodeling the cytoskeleton to effect changes in cell shape and migration. This protein interacts with integrins, transmembrane receptor complexes, and second messengers. Defects in this gene are a cause of several syndromes, including periventricular nodular heterotopias (PVNH1, PVNH4), otopalatodigital syndromes (OPD1, OPD2), frontometaphyseal dysplasia (FMD), Melnick-Needles syndrome (MNS), and X-linked congenital idiopathic intestinal pseudoobstruction (CIIPX). Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Mar 2009]

Forensic Context

A study in human pediatric sepsis patients demonstrated that the FLNA exhibited increased polyadenylation in whole blood samples from viral infections compared to bacterial infections, as identified using Nanopore direct RNA sequencing [He et al. DOI:10.1186/s12879-025-11078-z]. A study in *Sarcophaga peregrina* demonstrated that the FLNA shows an increasing expression tendency with intra-puparial age under both constant and fluctuating temperatures [Shang et al. DOI:10.3390/ani13101607].