Basic Information

Symbol
FLOT1
RNA class
mRNA
Alias
Flotillin 1 Flotillin-1 Integral Membrane Component Of Caveolae
Location (GRCh38)
6:30727709-30743075
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005803.4
Sequence length
1866.0 nt
GC content
0.5686

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-714.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -748.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 577.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001318875.2 NCBI
GCGUCUGCCGCAGCAACGGGGUGCGGCAGGGUGGGGAACGCGGGAGCGG… 1722 nt 0.5674
NM_005803.4 NCBI
GCGUCUGCCGCAGCAACGGGGUGCGGCAGGGUGGGGAACGCGGGAGCGG… 1866 nt 0.5686
Summary

This gene encodes an protein that localizes to the caveolae, which are small domains on the inner cell membranes. This protein plays a role in vesicle trafficking and cell morphology. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

A multi-omics study in human postmortem prefrontal cortex (Brodmann Area 9) identified widespread transcriptomic and epigenomic alterations in cocaine use disorder, with ZFAND2A being the only transcriptome-wide significantly upregulated gene [Zillich et al. DOI:10.1038/S41398-024-03139-9].