Basic Information

Symbol
FLOT2
RNA class
mRNA
Alias
Flotillin 2 ESA1 ESA ECS-1 M17S1 ECS1 Membrane Component, Chromosome 17, Surface Marker 1 (35kD Protein Identified By Monoclonal Antibody ECS-1) Membrane Component Chromosome 17 Surface Marker 1 Flotillin 2 (Epidermal Surface Antigen 1) Epidermal Surface Antigen Flotillin-2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Cause of death analysis

MANE select

Transcript ID
NM_004475.3
Sequence length
2668.0 nt
GC content
0.5903

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1113.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1161.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 566.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((((((((((.(((.(.....(((((.(((..(((..(((.(..((.((((((...)))))).))...).)))..))).))).)))))(((((((((..((....)).))))))))).(((.(((((.(((((((.(.((((((((((((.(((((..(((((....))))).)))))....))))))))))))..).))))))).))).))..)))..........((((..(((((((((((((.(((((.(((((((((((.(((((...((((((((((((((....)))))((((.(.(((((((...))))))).).))))...((((((..((((((..((((..((((.(.((...((((....))))...)).).)))).))))..)))))))))))).(((....)))..))))))))).((..(.((((((((..(......)..)))))))).)..))))))).)))))...(((((((..((((....))))..)))))))......)))))).))))).)))).)))))))))..))))..).))).))))))))........))))..((((((((((((...........((((....(((((.(((((....((((.(.(((((((((.(((.((((.((((((((....(((..((((((.((((.((((.(((.(((..(((.(.((((....(((..((..((((.(((....))).))))..((.((((((((((((...(((.((((.(((....((((.(((((((((((....((.(((......)))))...)))))))...(((.(((..((((((((((....(((((.(((((.....)))))((((..(((((((((.....(((..(((((((((.((.((((..(((((.((((((((((.((.((((.((((........)))).((((.((...((((((....((((((........(((.....)))...))))))((((((....))))))..(((..((.(((((.(((...)))...)))))....(((...((.((((.(((((((.(.......)))))))).)))).))...))).))..)))(((((.((.((.....((((.((((((((.((.(((((((((((.......)))))((((....))))...........(((((.((((((((((((((((.((((((.((((....(((...((((........))))(((((.(((((.((((.((((.....)))).))))....)))))...((.((((..((((((.......))).))).)))).))((((((..((.(((......))).)).)))...)))((((.(((.(((..(((.......))).)))))))))).(((.((((((.((...)).)))))).)))...........))))).....)))....)))).))))))........((((..........))))((((((((...((((((.((((......)))).))))))))))..))))....))))))))).))))))).)))))))))))))))))))))..)))))))).)))))))))))...)))))).....)))))).)))))..........)))))))))))))))).)))).........)))))..))).....))))).))))..))))........)))))..))))))......)))).))).)))(((((((((((...))))))))))).)))).))))))).)))).))))))).)))))..))).)).((((((((((.((((((((.(((((((((((((((((.((..((((.(((.(((((..((((........))))))))).)))..))))..))))))))))((((.....((((((((((((.......((((((.(((((((((....))).)))))).)))((((((.((((((((((....((..(((((((....((((((((.((.(..(((.(((((.(((((.(((((.......)))).).)))))))((((((((((..((((((((((((((((((.....))))....)))))))...))).))))..))))..))))))......))).)))..))))))))))))))).)))..))..(((((...((((..(((((......)))))..))))...)))))))))))......((((((.(((..........))).))))))))))))))))....)))......))))....)))))))).....))))...........)))))).)))))))))))((((((..((.((.(.((((..........))))))).))..))))))....)))))))))).))..)))..((.((((((((((((...))).))))))))).))(((.(((((......)))))))).((((.((((.((....((...)))).)))).)))).....))))).)))...))).))))))))))).)))))).)))...))))..)))).)))))))))))))))).).))))....)).))).)))))....))))............))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
......,((((((((((((.(((.{.....(((((.(((..(((..({({(..((.((((((...)))))).))...,,))},.))).))).)))))(((((((((..((....)).))))))))),(((.(((((.(((((((.,.((((((((((((.(((((..(((((....))))).)))))....))))))))))))..,.))))))).))).))..))).,......,.((((..(((((((((((((.(((((.((((((((,,,.,((((,.,.,((((.((..,{{(({{({{{{((((.(.(((((((...))))))).).)))}...((((((..((((((..((((..((((.(.,({{.((((....))))..})).).)))).))))..)))))))))))).(((....))).}}}))))))..,,..{.((((((((..(......)..)))))))).)||||||||}{}|,,,..,{||||||.,{{||}.,}))))..)))))),....,})))))).))))).)))))}})))))))..)))).,}.))).))))))))....,,,,))})..{(((((((((((,.,{....,,.((((..,.(((((.(((((....((((.(.(((((((((,(({.((((.((((((((....(((..((((((.((((.(((,{(((.(((..(((.(.((((,...(((..((..((((.(((....))).))))..((.(((((((({(((...(((.((((.(((,...{(((.(((((((((((....((.{((......)))))...)))))))...(((.(({{{{((.((((((....(((((.(((((.....)))))((((..(((((((((...,.((((((((((((((.{.(((((..(((({{((((({((({,((,(({(,((({........||||{{{{,.|||,{{{({{.,||||{||,,..,}.,|||,|,,..,||,...}}})}|((((((....)))))).|||,||||||||||.{{{,.,|}}.{{|||||....{{{|,.((.((((.(((((((.{.....,.}))))))).)))).))......{((((((.(((((.((.((.....((((.({((((({{((.(((({,(((((.......)))))((((....)))).........,{(((((.((((((((((((((((.((((((.((((....(({...{,,,{{.{,...,,,,||,||.(((((.((((.((((.....)))).))))....))))).|.,,.((((..((((((.......))),,)).)))).,((({(.({,{{,,{{,...(({{{,{{{..,,.,)))|||{,|{(.{{{..({{.......))).}}|})))}}}.(((.((((((.((...)).)))))).)))......,.,,.)))))....,))),...)))).))))))........((((..........))))((((.,,,.{{((((((.((((......)))).))))))})),..))))....))))))))).))))))).))))))))))))))))))))),.)))))))).)))))}))))),..})}),},}}),))}}))})))),...,.,,,,.)))))))))))))))}.))))},....,}),))))..,}}.,...))))).))))..))))........)))))..)))))).},,.,..)).))}.}})(((((((((((...))))))))))).)))).))))))).)))).)))))),.))))),.})).}}.((((((((((.((((((((.(((((((((((((((((,{(..((((.(((.((,{,,.((((........))))}))})}))),.))))..}}))))))))((((.....(((((((({{((.{..{..(((({{.(((((((((....))).)))))).||}((((((.((({{(({{,...{(({{(((((((....((((((({,((.(..(((.(((((.(((((.,((((.......)))).}.})))))}((((((((((..((((((((((((((((((.....))))....)))))))...)))}})))..)))),.})))))......))).)))..)))))))))))}})|,||},,|}..,|{|{.,.||{,,{,,,,{.,.}}}))))).,||||,,,|}}}||||}||,...,.(({{{{,|{|}|,,,,,,..)))})))))})))))))))),}})))),},.,.)))),...)))))))).....))))...........)))))).)))))))))))((((((..((.({{(.((((..........))))))).))..))))))....)))))))))).))..)))..{(.(((((((((,({...}}}.))))))))).)}({(((((((......)))))))).((((.((((.({.,..,,...,})).)))).))))....}))))).))).,.))).))))))))))).)))))).)))...))))..)))).)))))))))))))))).).))))....)).))).))))).,..)))).,,....,)...)))))))))))}

Transcripts

ID Sequence Length GC content
ACACUUCCGGCGGGGCUGCGACCGCAGAGGGGCGCGGGCGAGCGAGCGG… 2668 nt 0.5877
ACACUUCCGGCGGGGCUGCGACCGCAGAGGGGCGCGGGCGAGCGAGCGG… 2668 nt 0.5903
Summary

Caveolae are small domains on the inner cell membrane involved in vesicular trafficking and signal transduction. This gene encodes a caveolae-associated, integral membrane protein, which is thought to function in neuronal signaling. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human forensic autopsy cases using RNA sequencing demonstrated that the FLOT2 was upregulated in a case of fatal insulin overdose, where it functioned as an additional adaptor or signaling molecule within the insulin signaling pathway [Nakao et al. DOI:10.1016/j.legalmed.2025.102772].