Basic Information

Symbol
FLT3LG
RNA class
mRNA
Alias
Fms Related Receptor Tyrosine Kinase 3 Ligand Fms-Related Tyrosine Kinase 3 Ligand Fms Related Tyrosine Kinase 3 Ligand Flt3 Ligand SL Cytokine IMD125 FLG3L FLT3L Flt3L FL
Location (GRCh38)
19:49474150-49486233
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001459.4
Sequence length
1050.0 nt
GC content
0.6324

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-425.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -439.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 129.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001204502.2 NCBI
CCUUUCACUUUCGGUCUCUGGCUGUCACCCGGCUUGGCCCCUUCCACAC… 1101 nt 0.6240
NM_001204503.2 NCBI
CUUCUGUCCCUUCCAAGACCCGGCGACAGGAGGCAUGAGGGGCCCCCGG… 1051 nt 0.6223
NM_001278637.2 NCBI
CCUUUCACUUUCGGUCUCUGGCUGUCACCCGGCUUGGCCCCUUCCACAC… 1078 nt 0.6317
NM_001278638.2 NCBI
CCUUUCACUUUCGGUCUCUGGCUGUCACCCGGCUUGGCCCCUUCCACAC… 1067 nt 0.6345
NM_001459.4 NCBI
CCUUUCACUUUCGGUCUCUGGCUGUCACCCGGCUUGGCCCCUUCCACAC… 1050 nt 0.6324
Summary

Dendritic cells (DCs) provide the key link between innate and adaptive immunity by recognizing pathogens and priming pathogen-specific immune responses. FLT3LG controls the development of DCs and is particularly important for plasmacytoid DCs and CD8 (see MIM 186910)-positive classical DCs and their CD103 (ITGAE; MIM 604682)-positive tissue counterparts (summary by Sathaliyawala et al., 2010 [PubMed 20933441]).[supplied by OMIM, Jan 2011] CIViC Summary for FLT3LG Gene

Forensic Context

A study in human pediatric sepsis patients demonstrated that the FLT3LG exhibited increased polyadenylation in viral compared to bacterial infection samples when analyzed using Nanopore direct RNA sequencing of whole blood [He et al. DOI:10.1186/s12879-025-11078-z]. A study in mice demonstrated that lethal total-body irradiation significantly elevated serum FLT-3L (Flt3 ligand) from day 1 post-exposure, with an increasing linear trend through day 9, as validated by ELISA (p < 0.001) [Chakraborty et al. DOI:10.1038/s41598-020-62255-w]. This protein is identified as a marker for bone marrow aplasia and hematologic cancer, underscoring its role as an early signature of radiation-induced hematopoietic injury.