Basic Information
Symbol
FMO1
RNA class
mRNA
Alias
Flavin Containing Dimethylaniline Monoxygenase 1
Dimethylaniline Monooxygenase [N-Oxide-Forming] 1
Fetal Hepatic Flavin-Containing Monooxygenase 1
Flavin Containing Monooxygenase 1
Flavin-Containing Monooxygenase 1
Trimethylamine Monooxygenase
Dimethylaniline Oxidase 1
EC 1.14.13.8
FMO 1
Flavin-Containing Monooxygenase 1 (Fetal Liver)
EC 1.14.13.148
Location (GRCh38)
1:171248471-171285978
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
MANE select
Transcript ID
NM_001282693.2
Sequence length
2152.0 nt
GC content
0.4484
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-622.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-666.38 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
440.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| ACAUUUUCCUUCUCACAUUCACACACCAGAGACCCGCUACAGAAGAUUC… | 2198 nt | 0.4449 | |
| AGACCAGGUUUAUCCACUGUGCUGGGGACUCCCAAGCCAGCACUGGCUC… | 2152 nt | 0.4484 | |
| AGACCAGGUUUAUCCACUGUGCUGGGGACUCCCAAGCCAGCACUGGCUC… | 1963 nt | 0.4529 | |
| AGACCAGGUUUAUCCACUGUGCUGGGGACUCCCAAGCCAGCACUGGCUC… | 2143 nt | 0.4489 |
Summary
Metabolic N-oxidation of the diet-derived amino-trimethylamine (TMA) is mediated by flavin-containing monooxygenase and is subject to an inherited FMO3 polymorphism in man resulting in a small subpopulation with reduced TMA N-oxidation capacity resulting in fish odor syndrome Trimethylaminuria. Three forms of the enzyme, FMO1 found in fetal liver, FMO2 found in adult liver, and FMO3 are encoded by genes clustered in the 1q23-q25 region. Flavin-containing monooxygenases are NADPH-dependent flavoenzymes that catalyzes the oxidation of soft nucleophilic heteroatom centers in drugs, pesticides, and xenobiotics. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2013]
Forensic Context
A study in rats demonstrated that blast wave exposure induces oxidative stress, with the FMO1 showing no change after a 5 psi blast but becoming up-regulated at 2 hours and sustaining this elevation after 10–11 psi exposures, while also showing up-regulation at 24 and 72 hours after a 14–15 psi blast [Balaban et al. DOI:10.1016/j.jneumeth.2016.02.001].