Basic Information

Symbol
FMO2
RNA class
mRNA
Alias
Flavin Containing Dimethylaniline Monoxygenase 2 Flavin Containing Monooxygenase 2 (Non-Functional) Dimethylaniline Monooxygenase [N-Oxide-Forming] 2 Pulmonary Flavin-Containing Monooxygenase 2 Flavin-Containing Monooxygenase 2 Dimethylaniline Oxidase 2 Flavin Containing Monooxygenase 2 FMO, Pulmonary EC 1.14.13.- EC 1.14.13.8 FMO 1B1 FMO1B1 FMO 2
Location (GRCh38)
1:171185249-171212686
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001460.5
Sequence length
5215.0 nt
GC content
0.3726

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1264.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1366.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1393.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001301347.2 NCBI
ACACAACCAAGGGAGAAAACUAUUCUGUCAAAGAGACGGUGCCAAAAGG… 4934 nt 0.3666
NM_001365900.1 NCBI
UUCAGCUGGAAGAAUGCUGGAGGAAUACGGAACUCCUCCCAUUUCUCAC… 5166 nt 0.3720
NM_001460.5 NCBI
ACACAACCAAGGGAGAAAACUAUUCUGUCAAAGAGACGGUGCCAAAAGG… 5215 nt 0.3726
Summary

This gene encodes a flavin-containing monooxygenase family member. It is an NADPH-dependent enzyme that catalyzes the N-oxidation of some primary alkylamines through an N-hydroxylamine intermediate. However, some human populations contain an allele (FMO2*2A) with a premature stop codon, resulting in a protein that is C-terminally-truncated, has no catalytic activity, and is likely degraded rapidly. This gene is found in a cluster with other related family members on chromosome 1. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2014]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the FMO2 was upregulated as part of a battery of oxidative stress response genes at 24 hours after a 10–11 psi blast exposure [Balaban et al. DOI:10.1016/j.jneumeth.2016.02.001]. In human corpus cavernosum tissue, single-cell transcriptome analysis identified the FMO2 as a specific gene marker defining the PI16+/FMO2+ fibroblast subcluster (FB3) [Zhao et al. DOI:10.1038/s41467-022-31950-9].