Basic Information

Symbol
FN1
RNA class
mRNA
Alias
Fibronectin 1 CIG Cold-Insoluble Globulin Lnc-ABCA12-8 GFND2 LETS FINC MSF Migration-Stimulating Factor Fibronectin FN Epididymis Secretory Sperm Binding Protein SMDCF ED-B GFND FNZ
Location (GRCh38)
2:215360440-215436120
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_212482.4
Sequence length
8390.0 nt
GC content
0.5079

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2760.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2914.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2355.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001306129.2 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 8297 nt 0.5079
NM_001306130.2 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 7760 nt 0.5064
NM_001306131.2 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 7754 nt 0.5076
NM_001306132.2 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 7679 nt 0.5075
NM_001365517.2 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 8120 nt 0.5071
NM_001365518.2 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 8117 nt 0.5083
NM_001365519.2 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 8045 nt 0.5070
NM_001365520.2 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 8042 nt 0.5082
NM_001365521.2 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 8027 nt 0.5072
NM_001365522.2 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 7952 nt 0.5070
Showing 1 to 10 of 18 entries
Summary

This gene encodes fibronectin , a glycoprotein present in a soluble dimeric form in plasma, and in a dimeric or multimeric form at the cell surface and in extracellular matrix. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature protein. Fibronectin is involved in cell adhesion and migration processes including embryogenesis, wound healing, blood coagulation, host defense, and metastasis. The gene has three regions subject to alternative splicing, with the potential to produce 20 different transcript variants, at least one of which encodes an isoform that undergoes proteolytic processing. The full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jan 20 1 6] CIViC Summary for FN1 Gene

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the FN1 is a hub gene highly expressed in endothelial cells during myocardial infarction, and its inhibition via siRNA in hypoxic human umbilical vein endothelial cells promoted migration and tube formation [Wang et al. DOI:10.1186/s12872-024-03727-z]. In a rat model of pulmonary arterial hypertension-induced right ventricular failure, RNA sequencing identified the FN1 as upregulated in the right ventricle, associated with fibrotic pathways [Potus et al. DOI:10.3390/ijms19092730].