Basic Information

Symbol
FN1
RNA class
mRNA
Alias
Fibronectin 1 CIG Cold-Insoluble Globulin Lnc-ABCA12-8 GFND2 LETS FINC MSF Migration-Stimulating Factor Fibronectin FN Epididymis Secretory Sperm Binding Protein SMDCF ED-B GFND FNZ
Location (GRCh38)
2:215360440-215436120
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_212482.4
Sequence length
8390.0 nt
GC content
0.5079

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2760.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2914.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2355.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001365523.2 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 7772 nt 0.5075
NM_001365524.2 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 7757 nt 0.5077
NM_002026.4 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 8024 nt 0.5083
NM_054034.3 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 2388 nt 0.5255
NM_212474.3 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 7487 nt 0.5069
NM_212476.3 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 7847 nt 0.5076
NM_212478.3 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 7949 nt 0.5082
NM_212482.4 NCBI
GCCCGCGCCGGCUGUGCUGCACAGGGGGAGGAGAGGGAACCCCAGGCGC… 8390 nt 0.5079
Showing 11 to 18 of 18 entries
Summary

This gene encodes fibronectin , a glycoprotein present in a soluble dimeric form in plasma, and in a dimeric or multimeric form at the cell surface and in extracellular matrix. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature protein. Fibronectin is involved in cell adhesion and migration processes including embryogenesis, wound healing, blood coagulation, host defense, and metastasis. The gene has three regions subject to alternative splicing, with the potential to produce 20 different transcript variants, at least one of which encodes an isoform that undergoes proteolytic processing. The full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jan 20 1 6] CIViC Summary for FN1 Gene

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the FN1 is a hub gene highly expressed in endothelial cells during myocardial infarction, and its inhibition via siRNA in hypoxic human umbilical vein endothelial cells promoted migration and tube formation [Wang et al. DOI:10.1186/s12872-024-03727-z]. In a rat model of pulmonary arterial hypertension-induced right ventricular failure, RNA sequencing identified the FN1 as upregulated in the right ventricle, associated with fibrotic pathways [Potus et al. DOI:10.3390/ijms19092730].