Basic Information

Symbol
FNDC5
RNA class
mRNA
Alias
Fibronectin Type III Domain Containing 5 FRCP2 Fibronectin Type III Domain-Containing Protein 5 Fibronectin Type III Repeat-Containing Protein 2 Irisin
Location (GRCh38)
1:32862268-32872482
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_153756.3
Sequence length
2831.0 nt
GC content
0.5450

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1071.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1125.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 751.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001171940.2 NCBI
AGUCGCUGUCCGCGGAGCCGACAUGCAGGCGGCUCGGGGCGGCGCAGGG… 2182 nt 0.5573
NM_001171941.3 NCBI
AGCAAAGAGAAAAGAGAGAGAGAGGUGCUCUGGCUCCGGGGCUCUUCUC… 3022 nt 0.5235
NM_153756.3 NCBI
AGUCGCUGUCCGCGGAGCCGACAUGCAGGCGGCUCGGGGCGGCGCAGGG… 2831 nt 0.5450
Summary

This gene encodes a secreted protein that is released from muscle cells during exercise. The encoded protein may participate in the development of brown fat. Translation of the precursor protein initiates at a non-AUG start codon at a position that is conserved as an AUG start codon in other organisms. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2013]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that acute cold exposure (4°C for 4 hours) induced the browning of subcutaneous white adipose tissue, with histological confirmation of beige adipocyte appearance and RNA-sequencing identifying 714 differentially expressed genes [Liang et al. DOI:10.3390/ijms20163968].