Basic Information

Symbol
FOLR1
RNA class
mRNA
Alias
Folate Receptor Alpha FOLR Ovarian Tumor-Associated Antigen MOv18 Adult Folate-Binding Protein Folate Receptor 1 (Adult) Folate Receptor, Adult Folate Receptor 1 KB Cells FBP FR-Alpha FBP Folate Binding Protein FRalpha NCFTD FRα FRA
Location (GRCh38)
11:72189558-72196323
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016729.3
Sequence length
930.0 nt
GC content
0.5624

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-331.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -348.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 173.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..((((((.(((((((((((((...(((((.(((((((((...........((((((..(((((...((((.((((.((((((...(((((((((((.(..((..........))..).))))))))))).....))))).)..))))..))))...)))))..)))..)))............)))).))))).)))))..)))))))))))))..(.(((.((((.....)))).))).)(((((((((....))..))))))).((...............)).....))))))..)).))))..((((((((....((......(((((((......(((((...))).))..(((((...))))).))))))))).)))))))).((((((.(((((((...((.((((((.....)))))))).)))..(((((...(((((....((((.((......)).))))..)).))).((((((((((..(((.....(((.(((((.((((....((((((......(.(((((((....)))))..))))))))))))).)))))...))).....))).)))))).)))).....(((((((..(((((((....(((...........)))..)))))))((....)).)))))))((((..(....(((..(((((.....(((((.(((((((((.((((((...((..((((((((.(((((((((((((..(((((((...........)))))))))))))))))...)))...)))))))).))...))))))...))))))))).))...)))....)))))..)))....)..))))....(((.(((((..(((....)))..))))).))))))))....)))))))))).................
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((..((((((.(((((((((((((...(((((.(((((((((.{,.,......((((((..(((((.,.((((.((((.{(((((,,.(((((((((((.(..((.,,.....,,))..).)))))))))))..},.))))).,..))))..)))).,.)))))..)))..)))......,.,,..)))).))))).)))))..)))))))))))))..{.(((.((((.....}))).))),,(((((((((....))..)))))))..,......,.,,,....}),....))))))..)).))))..((((((((....{{......(((((((......(((((...))).))..(((({...})))).)))))))}}.)))))))).((((((.((((,,,.{{((,((((((.....))))))||.|||..|{{{(,{(((({({,..((((.((......)).)))),..,.},,.((((((((((..(((.....(((.(((((.((((....((((((......(,{.(((((....))))),,)}.)))))))))).)))))...))).....))).)))))).)))).....(((((((.,(((((((....(((..,........)))..)))))))|,....},.))))))){,(({,{{,,,{{(..(((((,,...(((((.(((((((((.((((((...,({{((((((((,(((((((((((((..(((((((...........)))))))))))))))))...})).},)))))))).,)}}.))))))...))))))))).))...)))....})))),,)))..,,},.}}}},},,,(({(,,,.,}||....,))},,}))))}}})}))))....)))))))))).................

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000802.3 NCBI
UCAAGGUUAAACGACAAGGACAGACAUGGCUCAGCGGAUGACAACACAG… 962 nt 0.5437
NM_016724.3 NCBI
GUAGAGCAGAGCAGAAGCCUGAGCCAGACGGAGAGCCACCUCCUCUCCC… 1021 nt 0.5642
NM_016725.3 NCBI
GUAGAGCAGAGCAGAAGCCUGAGCCAGACGGAGAGCCACCUCCUCUCCC… 955 nt 0.5665
NM_016729.3 NCBI
GCCACUGACCACAGCUCUUUCUUCAGGGACAGACAUGGCUCAGCGGAUG… 930 nt 0.5624
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the folate receptor family. Members of this gene family bind folic acid and its reduced derivatives, and transport 5-methyltetrahydrofolate into cells. This gene product is a secreted protein that either anchors to membranes via a glycosyl-phosphatidylinositol linkage or exists in a soluble form. Mutations in this gene have been associated with neurodegeneration due to cerebral folate transport deficiency. Due to the presence of two promoters, multiple transcription start sites, and alternative splicing, multiple transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2009]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.