Basic Information

Symbol
FOSB
RNA class
mRNA
Alias
FosB Proto-Oncogene, AP-1 Transcription Factor Subunit G0S3 GOSB GOS3 AP-1 FBJ Murine Osteosarcoma Viral Oncogene Homolog B Transcription Factor AP-1 Subunit FosB G0/G1 Switch Regulatory Protein 3 Activator Protein 1 DKFZp686C0818 Protein FosB MGC42291 FosB Proto-Oncogene, AP-1 Trancription Factor Subunit Oncogene FOS-B
Location (GRCh38)
19:45467995-45475179
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation Postmortem interval inference Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006732.3
Sequence length
3775.0 nt
GC content
0.5764

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1470.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1530.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1091.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.............((((((..(((...((((((((((..(((((...((((.(((((((.........((((.((((..((((((..((((....))))................((((((.((((.(((((((......))))))).))))..............((((((((((..........))))))))))......))))))..)))))).)))).)))).((((((((((((((((......((..(((((((.((((.(((.(((.(((......)))))))))((((((......)))))).((((..((.((((((((((((.(((((((...)))))...))))).))).)))))).)).))))...((((.....)))).......(((((((...(((((..(((......(((((((((..((((((((((((..(((......((((......)))))))..))))))).......)))))...((((.((((((.................(((((......)))))(((((((..........(((.(((((((....))))))).)))((((((.(((...)))))))))(((((.......)))))((.(((..(((..((((((..((((((..((((..........((((((((((((((((...)).))))))))....((((.((((((....))).))).))))(((((((....(((.(((((......(((((((((..((((...((((...(((((((....))..)))))))))........................((((........)))).((((((.((.(((..(((((((((.((((.......))))..))))))....((((((((............))))))))........)))))))).))))))..((((((.....))))))))))....))).))))))((((((......))))))...))))).)))........))))))).))))))))))....))))))..))))))..)))..))).)))))))))...........((((....))))..))))))..)))).)))))))))...))).)))))....))))))))))))))))))..))(((((....(((((((.((((..((((...((.(((.((....(((.((.((((.(.((((...(((((((((((((((.......)))).((..(..(((((......)))))..)..)).((((..(((((((((.(((.(((((((.((((((........(((.((.(((((.(((.((.((((((((.....((....((.......))....)).....))).)))))...)).))..........((((.(((((....((((((.....))))))...))))).))))((((.........))))...............).))))).)).))).......)))))))))))))))).)))))))))))))....))))))).))))...))))).))))..)).))))).))))).))))))))..)))))))....))))).....................(((.((((((((((((((.((((.((..(((((.((..((((((((((((((((((((((((.((...((.((((((((.((((((((((((((((((((((.(((((.((((((((.(((((.((((....((((((((.(........).))))))))(((((...(((...(((.((((((((((((((((.(((((((.....((((.(((((..(((((((((((.((((..((((((((....((((((........))))))...)))..)))))..(((((((((((((((((((((..((((......))))((((((.....))))))..((((((.(((((((.(((.((((((.((((...((((((....))))))....)))).))).........)))))).)))))))..))))))...)))))(((((......)))))((..(((((((..............)))))))..)).....((((.((((((.....)))))).))))...........((((........))))..((((...))))........))))))))(((....))).....))))))))...(((....)))........)))))))))).((((((..............((((((....((((((((((((.......(((((....))))).......))))..)))).....))))...))))))..))))))....)))))...))))).))))))))))).....)))).))))....)))))))).)))...)))...))))))))).))).)).)))..)))))((....))((((.....)))).......)))..)).)))))...)))).).))))))).))))).))))))))))((((((((...)))))).)).((((..........))))..)).)))))(((...(((((((((((.((((((......(((((...))))))))))).))........))))))))).)))......((((....)))))))))))))).)))))(((((...(((((((.((((((.......))))))......(((((.....(((((((.......((((((((((.....((((((((((.((((.((...)).)))))))))))))))))..........))))))).....((((((((((((.((((............((((.....))))...(((.(((((...(((((((((((....))))))).))))))))).)))........)))).)))))))))))).......(((........))).....((((((((((....)))))))))).......(((((....))))).(((((((((......)))))))))..(((.((((((.(((..((((.(((((((((.(....((((((((.......(((....)))..........(((.(((.....((((((..((...)))))))).....))).))).(((((((((.........))))))))))))))))).....).).))))))).).))))......)))))))))..))))))))))...)))))........((((((((.....((((((.....))))))......)))))).)).......))))))).....)))))....))))..)))))))..)).))))....)))))))))))))))))....))))))))))..))))))........)))))))...))))...)))))..))))))))))...)))((((..(((....))).))))....(((((.(((((((((.......)))))).((((((((((((((.....(.(((((((((.((.((((((..((....)).)))))))).))))))))).)(((.((((...((((.((((((.(...((((...)))).((((.((((((......((((.((((....((....))....))))...))))........)))))).))))...).))))))..))))....)))))))))))))).))).))))))).)))))....))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
........,,.,.((((((..(((...((((((((((..(((((...((((.(((((((.........({(({(((,..{(((((..((((....)))}................((((((.((((.(((((((......))))))).)))}..............{(((((((((..........)))))))))}......))))))..)))))).)))),)))).((((((((((((((((..(((((((..((((.((((((..,))|||}}||}.....||||||{{(((((((......))))},,({({{{(({((({{{((((((,({(((({...}))))...)}))).))).||||}|{||{||||{{.((((.....)))).,{,....,|||,,...{.,((({((((.(({{((((,......|}||,(((((((((.((((((((({,(({..((((.((.((.(((((((...(((.((((....((((..,{{.............,,,.))))....)))).))).))))))).)).)).))))(((.(((((((....))))))).)))((((((.((,...})))))))).((((((...(((({{(((....((((.{{...}}))))....)))))))).........))))))((((((((((...)).))))))))....{{....}},))}..)))))))))..))).)))))))}}))})}}}}}}..,|}|}}|},|||}.}}}|}..{{{,...{((((((....})..)))))})))......................,)))}},}.}))))))))}|...((((,...}}}),,((((((.((((.......))))..))))))...))))))).(,.,....,,..,|,|||}|((,{{.{{{|||(((({(((.((|{(,((((({...||},,}..{((({......,|((({{(((((......)))))))))|.(((((((...((((((((((.({({,,...|||......}})|..(((((.((((((((((((((,.((({{{{,.......{{((....}}}}..}}},,...,{((.((((((.,.....,..((((((((({|{.,,,.,...||.}}|....,,.,.....||.,.|)))))))))}.{.{{(((((({(((....}}}}..((..,((((((.{,{{(,,(({(((((((.......)))))}}..|..(((((......)))))..,((((.((({..{.((((((.((((({...|)))))((((.(((((((((((,,,({{{....)))})))))).)))))..)))))))))).....))))..)))).,,))))).,|)}.,}},}..,,.........,,.(((((....((((((.....))))))...))))))))))))}.,)))))})))})))}..)))..)))}).,.))))))))).))))).})).),))).)))))))......))))).)).,...((....)){((........)))})))}.......)},))})))))}))}}))))))))))..,}))).}}}.,,,............,,.(((.((((((((((((((.((((.((..(((((.((..((((,((((((((((((((((..,......(((((((((((((((.(...((.((........)}.)}...|.)))))).})}))))}(((({.(((..(((((({,,,..,{{{.|{((((({(((,.,{.,.{(((({(((((.((((((((((,(((((({.....((((.(((((,,((((({(((((,({{(,{((((((((....((((((........))))))...))),.,)))).,((((((((((((((((((((({.((((......)))){(((((.....)))))}{((((..{(({(((((((({{{{,.((((((,((((,,(((.{{{||,,,}}},|}))).............))).).))))))}}..}))))))))).))),}))}}...,,(((({((..{((..{{...}}}},}))).))))),,,..,......((((.((((((.....)))))).)))).,,,}}}},,.((((........))))..(({,...})))........)))))))),((....,}).....)))))))),..(((....))}..},,..,)))),})))}.{{{{{{...,,,.,......((((({..,,(({{((((((((.......(((((....))))).......))}..}))))...,,))}}...))))))..}||}}},,,,))})}...)))))|))),,}|||)).,.,.}))),)))}},,||||{|.|{{{{|.{,,{{{{{|,,((((({{{{(.{{......)).))))))))).,,,|.....,,,,.)}})))))).,))))})},...)))))}))))}))),))))))),)))}..,,||((((({...)))))),.,,||{,.,,..,}}}}}}})}}},.,.,},(({,,.((((((((({,,(({{((......{|||,..,)}}}))))))),)),.},,.})))))))))),)))}})))))).)))..)))))}))))))))))))))|(((....,,,{,}||(({{{{.......,,||||....}}||..,.....{{{{{{{..,....((((((((({.....((((((((((.(((({(...,)},))),)))))))))))))..........))))))).....{({(((((((((.((({....,,,,....((({.....))))...(((.(((((...(((((((((((....))))))).))))))))).)))....,..,)}}}.)))))))))})}.......,({,{,...,.)}},....{(((((((((....)))))))))}.......{{{{{....})}}}.(((((((((......)))))))))..{((,((((((,{,,..(((({{{((((((,,,....(((((({{.......(((....)))..........{((.(({.....((((((..{{...}})))))).....})}.))}.,((((((((.......,.)))))))))))))))}),,,},),).)))))))})}))}},,}}}},}}))))))..)))))}}))),..}}}))},.....,{{(((({(,,....|||.|,,.}}))}||{{{{....((.((((((({...)))))))),),.,)))))..,.))))..)))))))..)).))))....))))))))))))))))).,,.))))))))))..))))))........)))))))...))))...)))))..))))))))))...}}}{(((..(((....))).))))},,.(((((,((({{{(({,,,,{{,|,,,,,}|||||||{{({(((..,..,.(((((((((.((.((((((..({....}).)))))))).))))))))),|({(,((((...{{||}|||{{{.|,,..,||..}),,||{{|{.((((((.....,((((.((((..,.{{....}}....)))}...))),..|.....)))))).,)))|,...}}|||}..}})),},,)),,))))))}}))}}}),))})))).)))))....))}))}..........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001114171.2 NCBI
AUUCAUAAGACUCAGAGCUACGGCCACGGCAGGGACACGCGGAACCAAG… 3667 nt 0.5754
NM_001411069.1 NCBI
AUUCAUAAGACUCAGAGCUACGGCCACGGCAGGGACACGCGGAACCAAG… 3635 nt 0.5739
NM_006732.3 NCBI
AUUCAUAAGACUCAGAGCUACGGCCACGGCAGGGACACGCGGAACCAAG… 3775 nt 0.5764
Summary

The Fos gene family consists of 4 members: FOS, FOSB, FOSL1, and FOSL2. These genes encode leucine zipper proteins that can dimerize with proteins of the JUN family, thereby forming the transcription factor complex AP-1. As such, the FOS proteins have been implicated as regulators of cell proliferation, differentiation, and transformation. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for FOSB Gene

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the FOSB mRNA is a differentially expressed gene exhibiting a consistent trend in expression from young adulthood to later life and was identified as a predictive feature for a robust age estimation model using peripheral blood, achieving a mean absolute error of 6.72 years on a test set [Liao et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103373]. In a separate human study, the FOSB mRNA was found to be down-regulated in the stromal vascular fraction from erectile dysfunction patients compared to healthy controls, as validated by qRT-PCR, and was linked to altered TGF-β signaling pathways [Vishnubalaji et al. DOI:10.1042/BSR20181015]. A study in zebrafish demonstrated that the FOSB transcript, an AP-1 component, increased in abundance within 0.3 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].